指甲根部凹陷可能由多种因素引起，包括营养缺乏（如维生素A、B族维生素、钙、铁等矿物质缺乏）、疾病因素（如甲癣、银屑病、慢性呼吸系统疾病）、外伤因素（如甲床损伤）、遗传因素以及长期接触某些刺激性物质等。
一、营养缺乏相关
1.维生素缺乏：
维生素A：维生素A对皮肤和指甲的健康至关重要，缺乏时可能导致指甲根部凹陷。研究表明，维生素A参与上皮组织的正常分化等过程，当体内维生素A水平不足，指甲的生长状态会受到影响，出现根部凹陷等异常情况。一般在长期挑食、节食的人群中较易出现这种因维生素A缺乏导致指甲根部凹陷的情况，尤其是儿童长期饮食不均衡时更易发生。
B族维生素：特别是生物素（维生素B7），它在维持指甲正常结构和功能方面发挥着重要作用。如果机体缺乏生物素，会影响指甲角蛋白的合成，进而引起指甲根部凹陷等改变。一些患有胃肠道疾病导致吸收不良的人群，或者长期大量饮酒的人，容易出现B族维生素缺乏，从而可能出现指甲根部凹陷现象。
钙、铁等矿物质缺乏：钙是构成指甲的重要成分之一，缺铁会影响血红蛋白的合成，导致机体各组织器官供氧不足，也会影响指甲的正常生长。例如缺铁性贫血患者，除了有贫血相关表现外，指甲可能会出现根部凹陷、色泽改变等情况。在儿童生长期，如果钙摄入不足，会影响骨骼和指甲等的正常发育，出现指甲根部凹陷；女性在生理期、孕期等特殊时期，对铁、钙等矿物质需求增加，若摄入不足也易出现此类指甲问题。
二、疾病因素相关
1.甲癣：
由皮肤癣菌等真菌感染甲板及甲下组织引起，除了指甲根部凹陷外，还常伴有指甲增厚、变色（如变黄、变黑等）、甲分离等表现。真菌会破坏指甲的正常结构和生长过程，导致指甲根部出现凹陷等异常。免疫力较低的人群，如糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的人等，更容易感染甲癣出现指甲根部凹陷情况。儿童免疫力相对较弱，若接触了被真菌污染的物品等也可能感染甲癣导致指甲根部凹陷。
2.银屑病：
是一种慢性炎症性皮肤病，若累及指甲，可出现指甲根部凹陷，表现为“顶针样”凹陷，即指甲表面有许多小的凹陷点，类似顶针的形状。银屑病是由遗传因素与环境因素等多种因素相互作用引起的免疫介导的慢性、复发性、炎症性皮肤病，其发病机制与免疫系统异常有关。患有银屑病的人群，无论儿童还是成人，都可能出现指甲根部凹陷的情况，而且病情活动期时指甲表现可能会更明显。
3.慢性呼吸系统疾病：
像慢性阻塞性肺疾病等，患者由于长期慢性缺氧，会影响指甲的生长状态，导致指甲根部凹陷。因为长期缺氧会使机体的血液循环和营养供应受到一定影响，进而波及指甲的正常生长。此类患者多为中老年人群，有长期吸烟等不良生活方式，本身存在慢性呼吸系统疾病病史，长期患病过程中可能逐渐出现指甲根部凹陷的表现。
三、外伤因素相关
1.甲床损伤：
手指受到外伤，如被重物砸到、过度挤压等，导致甲床受损，会影响指甲的正常生长，从而出现指甲根部凹陷的情况。儿童活泼好动，在玩耍过程中容易发生手指外伤，导致甲床损伤进而出现指甲根部凹陷；成年人在工作、生活中若不注意保护手指，也可能因外伤引起甲床损伤出现该症状。一般有明确的手指外伤史，受伤后一段时间发现指甲根部出现凹陷，可考虑与甲床损伤有关。
四、其他因素相关
1.遗传因素：
部分人可能存在遗传倾向，家族中有指甲容易出现根部凹陷等异常情况的亲属，个体发生指甲根部凹陷的概率可能相对较高。遗传因素通过影响指甲生长相关的基因等，使个体容易出现指甲根部的结构异常。这种情况在有家族史的人群中需要考虑，比如家族中多人都存在指甲根部凹陷且无其他明确疾病因素时，要想到遗传因素的可能。
2.长期接触某些物质：
长期接触具有刺激性的化学物质，如指甲油中的某些化学成分、洗涤剂等，可能会损伤指甲，导致指甲根部凹陷。例如一些从事美甲工作的人群，长期频繁接触指甲油等化学物质，容易出现指甲异常包括根部凹陷；家庭主妇长期接触洗涤剂等，也可能因化学物质的刺激导致指甲根部凹陷。这类人群有明确的长期接触刺激性化学物质的职业或生活暴露史，通过避免接触相关物质后可能会有一定改善。
