幽门螺旋杆菌即幽门螺杆菌，胃镜一般能查出幽门螺杆菌。
在进行胃镜检查时，医生可在胃内取组织样本，然后通过病理检查或快速尿素酶试验来检测是否存在幽门螺杆菌。病理检查是在显微镜下观察组织中有无幽门螺杆菌的存在，该方法准确性较高，能直观看到细菌形态及与组织的关系；快速尿素酶试验则是利用幽门螺杆菌能产生尿素酶的特性，当组织样本放入含有尿素的试剂中，若有幽门螺杆菌，其产生的尿素酶会分解尿素，使试剂颜色改变，从而判断是否感染，此方法操作简单、出结果快。
除了胃镜检查外，还有一些非侵入性的检测方法。如碳-13或碳-14呼气试验，患者只需口服特定的胶囊后呼气，仪器就能检测呼出气体中是否含有幽门螺杆菌分解尿素产生的二氧化碳，该方法无痛、无创，适合大多数人群，但对于近期服用过抗生素、铋剂、质子泵抑制剂等药物的患者，可能会影响检测结果。
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