尿道下裂的发生与遗传因素、激素水平异常、环境因素及胚胎发育过程中的机械因素有关，遗传具一定倾向、激素异常影响尿道形成、孕期环境暴露及胚胎机械干扰均可能致尿道下裂，男性胎儿更易受相关因素影响。
激素水平异常
雄激素相关：在胎儿发育过程中，雄激素对尿道的正常形成至关重要。如果胎儿体内雄激素合成不足或雄激素作用障碍，会影响尿道沟的融合等过程，进而导致尿道下裂。例如，胎儿肾上腺合成雄激素的关键酶缺乏等情况，会使雄激素水平降低，影响尿道的正常发育。男性胎儿在激素水平异常的情况下更容易出现尿道下裂问题，因为男性尿道发育对雄激素的依赖程度更高。孕期母体激素水平的异常也可能通过影响胎儿激素环境而间接导致尿道下裂，比如母体患有某些内分泌疾病影响了胎盘对激素的传递等。
环境因素
孕期环境暴露：孕妇在孕期接触某些环境污染物可能增加胎儿患尿道下裂的风险。例如，接触某些工业化学物质，如邻苯二甲酸酯类等，这些物质可能干扰胎儿的内分泌系统，影响尿道发育相关的激素调节和细胞分化等过程。不同生活方式的孕妇，若接触这类环境污染物的概率不同，比如长期处于有工业污染环境工作的孕妇，风险相对较高。另外，孕期母亲吸烟、饮酒等不良生活方式也可能通过改变体内环境，对胎儿尿道发育产生不利影响。吸烟产生的多种有害物质会进入母体血液循环，影响胎盘功能和胎儿的激素平衡等，饮酒也可能干扰胎儿的正常发育进程，增加尿道下裂的发生几率。
胚胎发育过程中的机械因素
在胚胎发育早期，尿道的形成是一个复杂的动态过程。如果在这个过程中存在机械性的干扰因素，也可能导致尿道下裂。例如，胚胎时期尿道沟的融合受到外界压力等机械因素影响时，可能会出现融合不全等情况，从而引发尿道下裂。这种机械因素的影响与胎儿在子宫内的位置等有关，不同胎位的胎儿可能面临不同的机械力作用情况，但目前对于具体的机械因素如何精确导致尿道下裂的机制还在进一步研究中。不过可以明确的是，胚胎发育过程中的机械因素是导致尿道下裂的一个可能原因，且男性胎儿由于尿道发育的特殊性，更容易受此类因素影响。
