目前虽无确切普遍适用的完全预防尿道下裂方法，但可通过孕期保健（保证营养均衡、尤其摄入足够叶酸，避免接触有害物质、谨慎用药）、遗传因素方面（家族有遗传病史备孕前进行遗传咨询）、生活方式方面（保持良好生活方式、避免吸烟酗酒）等措施降低风险。
营养因素：孕妇在孕期应保证营养均衡，尤其要摄入足够的叶酸。有研究表明，孕妇缺乏叶酸可能与尿道下裂的发生相关。充足的叶酸摄入有助于胎儿正常的胚胎发育，降低包括尿道下裂等先天性畸形的发生风险。例如，大量的流行病学调查发现，孕期合理补充叶酸的孕妇所生育的婴儿，尿道下裂的发生率相对较低。
避免接触有害物质：孕妇应避免接触环境中的有害物质，如某些化学毒物、放射性物质等。长期接触苯、甲醛等化学物质的环境可能会增加胎儿发生尿道下裂的可能性。因此，孕妇要远离化工园区等污染严重的区域，在工作中如果涉及接触有害物质，应及时调换工作岗位，以减少对胎儿发育的不良影响。
谨慎用药：孕期用药需格外谨慎，一些药物可能会对胎儿的生殖系统发育产生影响。孕妇应在医生的指导下合理用药，避免自行服用未经医生认可的药物。例如，某些抗癫痫药物等在孕期使用不当可能与尿道下裂的发生存在关联，所以必须严格遵循医嘱用药。
遗传因素方面：如果家族中有尿道下裂的遗传病史，夫妇在备孕前应进行遗传咨询。通过遗传咨询可以评估子代患尿道下裂的风险，并采取相应的监测措施。比如进行产前的基因检测等相关检查，以便在孕期早期发现胎儿是否存在与尿道下裂相关的遗传异常情况，从而采取进一步的应对措施，如必要时可能需要终止妊娠等，但这需要充分权衡利弊并在专业医生的指导下进行。
生活方式方面：孕妇在孕期应保持良好的生活方式，避免吸烟、酗酒等不良行为。吸烟和酗酒会影响孕妇的身体状况以及胎儿的发育环境，增加胎儿出现先天性畸形包括尿道下裂的风险。研究显示，吸烟的孕妇所生婴儿患尿道下裂的概率高于不吸烟的孕妇，酗酒同样会对胎儿的生殖系统发育造成不良影响，所以孕妇要坚决摒弃这些不良生活方式。
总体而言，虽然不能绝对预防尿道下裂的发生，但通过孕期的科学保健、避免接触有害物质、谨慎用药以及遗传咨询等措施，可以在一定程度上降低尿道下裂的发生风险。
