短肠综合征因小肠吸收面积显著减少引起，症状包括：腹泻，因剩余小肠短致消化吸收受限，结肠受刺激蠕动加快，次数多，粪便稀水样或糊状含未消化成分；营养不良，小肠吸收面积减少致多种营养物质吸收障碍，出现体重下降、消瘦、贫血等；水电解质紊乱，腹泻致水、电解质丢失，引发低钠、低钾等，有相应表现；其他症状，长期营养不良致骨代谢异常易骨折，维生素缺乏有凝血、口角炎等相关表现。
腹泻
发生机制：由于剩余小肠长度缩短，肠道消化吸收功能受限，大量未被充分消化吸收的食物残渣进入结肠，刺激结肠蠕动加快，从而引起腹泻。例如，当剩余小肠不足100cm时，腹泻往往较为明显。不同年龄人群表现可能有所差异，儿童由于肠道代偿能力相对较弱，腹泻可能更为频繁，严重时可导致脱水等并发症。
表现特点：腹泻次数可多达每日十余次甚至数十次，粪便多为稀水样或糊状，含有未消化的食物成分。
营养不良
发生机制：小肠是人体吸收营养物质的主要场所，短肠综合征患者小肠吸收面积减少，会导致蛋白质、脂肪、碳水化合物、维生素、矿物质等多种营养物质吸收障碍。比如，脂肪吸收障碍可导致患者出现脂肪泻，表现为粪便油腻、量多、有恶臭；蛋白质吸收不良会使患者出现低蛋白血症，表现为水肿、消瘦等。在不同性别上，一般无明显差异，但女性可能因营养状况影响月经周期等。对于儿童来说，会严重影响其生长发育，导致身高、体重增长缓慢，智力发育也可能受到一定影响。
表现特点：患者可出现体重下降、消瘦、皮肤干燥、毛发干枯、贫血（因铁、叶酸、维生素B等吸收障碍导致）等表现，还可能出现维生素缺乏相关症状，如维生素D缺乏可引起骨质疏松、手足抽搐等，维生素A缺乏可导致夜盲症等。
水电解质紊乱
发生机制：腹泻导致大量水分、电解质丢失，如果不能及时补充，就会引起水电解质紊乱。例如，大量丢失含钠、钾等电解质的肠液，可导致低钠血症、低钾血症等。在病史方面，如果患者原本就有胃肠道疾病导致短肠综合征，其水电解质紊乱可能更容易发生且纠正相对困难。对于不同年龄人群，儿童对水电解质紊乱的耐受能力更差，一旦发生，病情变化可能较快。
表现特点：低钠血症可表现为乏力、精神萎靡、恶心、呕吐等；低钾血症可出现肌无力、腹胀、心律失常等；严重时可出现意识障碍等危及生命的情况。
其他症状
骨代谢异常：长期营养不良可影响骨代谢，导致骨密度降低，易发生骨折等。尤其是儿童和中老年患者，儿童处于骨骼生长发育阶段，骨代谢异常会严重影响骨骼正常生长；中老年本身骨量就有流失趋势，短肠综合征导致的骨代谢异常会加速骨质疏松的进展。
维生素缺乏相关表现：除了上述提到的维生素A、D缺乏相关表现外，维生素K缺乏可导致凝血功能异常，出现皮肤瘀斑、鼻出血等；维生素B族缺乏可引起口角炎、舌炎等。
