咽喉囊肿有常见局部症状和伴随全身症状，局部症状包括咽喉异物感（囊肿小时吞咽时更明显，不同人群表现及相关诱因不同）、声音改变（囊肿长在影响发声部位致声音嘶哑，不同人群受影响及相关诱因不同）、吞咽困难（较大囊肿致吞咽困难，不同年龄段表现及相关诱因不同）；全身症状有呼吸困难（囊肿大阻塞气道时出现，不同人群病情表现及相关诱因不同）、反复咳嗽（囊肿刺激黏膜引起，不同人群受影响及相关诱因不同）。
一、常见局部症状
1.咽喉异物感
囊肿较小时，患者常感觉咽喉部有异物存在，好像有东西堵着一样，这种异物感在吞咽时可能会更加明显。就像喉咙里总是卡着一个小疙瘩，不管是吞咽唾液还是进食时都能感觉到。不同年龄、性别的人群都可能出现，对于儿童来说，可能会表现为频繁清嗓子，因为他们不太会准确表达咽喉的异物感；而成年人则更易直接诉说咽喉有异物感。生活方式方面，长期用嗓过度的人群，如教师、歌手等，由于咽喉经常处于紧张状态，更容易出现咽喉异物感相关症状。有咽喉病史的人群，如曾经患过咽喉炎等疾病的人，咽喉囊肿时异物感可能会更突出。
2.声音改变
若囊肿长在会厌等影响发声结构的部位，会导致声音嘶哑。声音嘶哑的程度会因囊肿大小和部位而异，较小的囊肿可能仅表现为声音稍微变粗、音调改变，较大的囊肿则可能引起明显的声音嘶哑，甚至完全失音。儿童如果出现咽喉囊肿导致的声音改变，可能会影响其语言发育，因为儿童时期语言交流主要依赖正常的声音表达；女性患者如果因声音改变影响工作或社交，可能会带来较大心理压力；男性患者若从事对声音要求高的职业，如播音等，声音改变会严重影响其职业发展。生活方式上，长期大声说话、吸烟等不良生活习惯会加重声音改变的程度，有咽喉疾病病史的人群发生声音改变的风险相对更高。
3.吞咽困难
较大的咽喉囊肿可能会阻塞咽喉部位，导致吞咽困难。轻者可能表现为吞咽时有梗阻感，吞咽固体食物时感觉不顺畅；重者可能几乎不能吞咽食物和水。不同年龄段人群吞咽困难的表现有所不同，儿童可能会出现拒食现象，因为吞咽困难会让他们进食时感到疼痛或不适；老年人由于本身吞咽功能可能有所下降，咽喉囊肿导致的吞咽困难可能会进一步影响其营养摄入，增加营养不良的风险。生活方式中，饮食过烫、过硬等不良习惯可能会加重吞咽困难的症状，有咽喉手术史等病史的人群，咽喉囊肿引发吞咽困难的可能性相对更大。
二、伴随全身症状
1.呼吸困难
当咽喉囊肿非常大，阻塞了气道时，会出现呼吸困难的症状。轻度呼吸困难表现为呼吸急促，在活动后更为明显；严重时可能会出现吸气性呼吸困难，患者吸气时胸廓周围软组织凹陷，如锁骨上窝、胸骨上窝等部位凹陷，同时可能伴有口唇发绀等缺氧表现。儿童由于气道相对狭窄，咽喉囊肿导致呼吸困难时病情进展可能更快，需要更加密切的关注；老年人本身心肺功能可能较差，咽喉囊肿引起的呼吸困难可能会加重心肺负担，导致心脑血管意外等更严重并发症的发生风险增加。生活方式中，剧烈运动等情况可能会诱发或加重呼吸困难，有呼吸系统疾病病史的人群，咽喉囊肿合并呼吸困难时病情更复杂。
2.反复咳嗽
咽喉囊肿刺激咽喉部黏膜，可引起反复咳嗽。咳嗽可能为刺激性干咳，也可能伴有少量痰液。儿童由于咽喉反射较敏感，咽喉囊肿导致的反复咳嗽可能会影响其睡眠和生长发育；对于有过敏体质的人群，咽喉囊肿引起的反复咳嗽可能会被误认为是过敏引起的咳嗽而延误病情；长期吸烟的人群，咽喉囊肿导致的咳嗽可能会被吸烟相关咳嗽掩盖，容易漏诊。生活方式上，接触刺激性气体等因素会加重反复咳嗽的症状，有慢性咳嗽病史的人群，咽喉囊肿引发反复咳嗽时需要仔细鉴别诊断。
