慢性扁桃体炎有局部和全身症状及局部检查体征，局部症状包括反复发作咽痛、异物感、分泌物溢出；全身症状有消化不良、头痛乏力、低热；局部检查可见扁桃体大小及隐窝口变化，儿童患者可能影响生长发育，女性妊娠期发作需谨慎处理，有基础疾病者易诱发感染加重，长期烟酒者症状易加重。
反复发作咽痛：患者常有咽痛发作史，平时可有咽部不适感。儿童扁桃体过度肥大时，可能出现呼吸不畅、睡眠打鼾、吞咽或言语共鸣障碍等。这是因为肥大的扁桃体阻塞呼吸道，影响正常呼吸、吞咽及发声功能。例如，儿童在睡眠时可能因扁桃体肥大导致气道狭窄，出现打鼾且睡眠不安稳的情况。
异物感：患者常感觉咽部有异物感，总觉得有东西卡在喉咙里，尤其是在吞咽时可能更明显。这是由于扁桃体反复炎症刺激，导致咽部神经感觉异常。
分泌物溢出：有时患者会自觉从口腔吐出白色腥臭分泌物，这是扁桃体隐窝内积存的脱落上皮细胞、淋巴细胞及细菌等形成的干酪样物。
全身症状
消化不良：慢性扁桃体炎可能引起全身反应，导致消化不良，出现食欲减退、腹胀、腹痛等症状。这可能是因为扁桃体病灶产生的毒素或变态反应，影响了胃肠道的消化功能。
头痛、乏力：部分患者可出现头痛、乏力等全身不适症状。这与机体对扁桃体病灶产生的免疫反应有关，毒素被吸收后引起全身症状。
低热：患者可能有低热表现，体温一般在37.5℃左右波动。这是因为扁桃体持续存在炎症，机体处于慢性炎症反应状态，导致体温调节中枢功能紊乱。
局部检查体征
扁桃体大小：扁桃体大小可分为不同程度，常见Ⅱ-Ⅲ度肥大，但也有部分患者扁桃体大小正常，但表面有瘢痕、凹凸不平，与周围组织有粘连。例如，有的患者扁桃体表面可见瘢痕组织，质地较硬，与隐窝口粘连。
隐窝口变化：扁桃体隐窝口可见黄白色干酪样点状物，挤压扁桃体时，这些点状物可从隐窝口溢出。同时，扁桃体充血，表面黏膜呈暗红色。
对于儿童患者，慢性扁桃体炎可能对其生长发育产生影响，如导致睡眠呼吸暂停，进而影响血氧饱和度，影响身体的正常发育。女性患者在妊娠期如果慢性扁桃体炎发作，可能需要更谨慎地处理，因为药物使用需考虑对胎儿的影响。而有其他基础疾病的患者，如糖尿病患者，慢性扁桃体炎可能更容易诱发感染加重，因为高血糖环境有利于细菌生长繁殖。在生活方式方面，长期吸烟、饮酒的患者，慢性扁桃体炎的症状可能更易加重，因为烟酒会刺激咽部黏膜，降低局部抵抗力。
