细菌性结膜炎常用抗生素类眼药水有喹诺酮类（如氧氟沙星眼药水，抑制细菌DNA复制杀菌）和氨基糖苷类（如妥布霉素眼药水，抑制细菌蛋白质合成）；儿童用药需谨慎选温和合适药物、规范操作并密切观察反应；孕妇用药要权衡利弊，在医生指导下选相对安全药物；老年人用药要考虑基础疾病及药物相互作用，选药要考虑刺激性，从小剂量低浓度开始尝试。
喹诺酮类：如氧氟沙星眼药水，其通过抑制细菌DNA旋转酶和拓扑异构酶Ⅳ的活性，阻碍细菌DNA复制从而发挥杀菌作用，对多种引起细菌性结膜炎的常见病菌有良好抗菌活性，包括葡萄球菌属、链球菌属等常见致病菌。研究表明，氧氟沙星眼药水能有效缩短细菌性结膜炎患者的症状缓解时间，如眼痛、畏光、分泌物增多等症状的改善时间明显缩短。
氨基糖苷类：妥布霉素眼药水是代表药物，它主要作用于细菌核糖体30S亚基，抑制细菌蛋白质合成。对金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌等有较好抗菌效果，临床应用显示，妥布霉素眼药水可显著降低细菌性结膜炎患者眼部分泌物中的细菌数量，加快炎症消退。
特殊人群注意事项
儿童
儿童患细菌性结膜炎时，由于其眼部组织发育尚未完全成熟，在选择眼药水时需格外谨慎。一般优先选择相对温和且抗菌谱合适的药物，如低浓度的妥布霉素眼药水。同时要注意用药时的操作规范，避免污染眼药水，因为儿童可能不太能配合精准用药，家长在给儿童用药时要轻柔操作，防止损伤儿童眼部娇嫩的组织。并且要密切观察儿童用药后的反应，如出现眼部红肿加重、异常哭闹等情况，应及时就医。
孕妇
孕妇患细菌性结膜炎时，用药需权衡利弊。某些抗生素类眼药水可能会对胎儿产生潜在影响，所以应在医生指导下选择相对安全的药物。例如，可先尝试相对温和的局部清洁等非药物干预方法，如果病情需要使用眼药水，要选择经过严格评估相对安全的品种，如部分研究显示在医生指导下谨慎使用的红霉素眼药水，其对孕妇及胎儿的潜在风险相对较低，但仍需在医生严密监测下使用。
老年人
老年人患细菌性结膜炎时，往往合并其他基础疾病，在用药时要考虑药物间的相互作用。同时，老年人眼部的生理功能有所减退，用药后吸收、代谢等过程可能与年轻人不同。选择眼药水时要考虑药物的刺激性等因素，比如一些老年人可能对某些眼药水的成分更敏感，使用时要从小剂量、低浓度开始尝试，观察眼部反应，如使用氧氟沙星眼药水时，要注意监测老人的眼部适应情况以及是否有全身药物吸收带来的影响。
