脸上长黑痣与遗传因素、紫外线照射、胚胎发育时期异常、激素水平变化、年龄因素、皮肤损伤等相关，遗传使个体具易长黑痣基因基础，紫外线致黑色素细胞活跃产黑色素，胚胎期黑色素细胞异常聚集，激素变化刺激黑色素细胞，年龄增长致皮肤变化易长痣，皮肤损伤后修复致黑色素细胞异常分布。
遗传因素：部分黑痣的形成与遗传有关。如果家族中有黑痣相关的遗传倾向，那么个体发生黑痣的概率可能会相对较高。例如，某些常染色体显性遗传的疾病可能伴有特定类型黑痣的高发情况，这种遗传因素是由基因决定的，从亲代遗传给子代，使得子代在胚胎发育等过程中就具备了更容易形成黑痣的基因基础。
紫外线照射：长期暴露在紫外线下是导致黑痣形成的重要环境因素。紫外线会损伤皮肤细胞中的DNA，促使黑色素细胞过度活跃，产生过多的黑色素。黑色素聚集就容易形成黑痣。比如，长期从事户外工作且没有做好防晒措施的人群，脸上出现黑痣的几率往往比室内工作者更高。在紫外线的作用下，皮肤为了抵御损伤会刺激黑色素细胞合成更多黑色素来保护皮肤，进而逐渐形成可见的黑痣。
胚胎发育时期的异常：在胚胎发育过程中，如果黑色素细胞在迁移过程中出现异常聚集，也会导致脸上出现黑痣。胚胎发育是一个复杂的过程，黑色素细胞原本要迁移到正确的位置分布，如果在这个迁移过程中受到某些未知因素影响而聚集在脸部特定区域，就会形成黑痣。这种情况是在胎儿时期就已经奠定了黑痣形成的基础。
激素水平变化：体内激素水平的变化也可能与黑痣形成有关。例如，青春期、怀孕等时期，体内激素水平波动较大。在青春期，身体的内分泌系统活跃，激素水平改变可能会刺激黑色素细胞增多，从而增加长黑痣的可能性；女性怀孕时，体内雌激素、孕激素等水平大幅变化，也可能导致脸上出现黑痣，这被称为“妊娠斑痣”等情况，是激素影响黑色素细胞功能和分布的结果。
年龄因素：随着年龄的增长，皮肤的新陈代谢等功能会发生变化，黑色素细胞的功能也可能出现波动，这使得人在年龄增长过程中更容易长出黑痣。儿童时期相对较少长黑痣，随着年龄增加到青少年、成年乃至老年，脸上长黑痣的几率逐渐升高。例如，老年人脸上往往比年轻人有更多的黑痣，就是因为随着年龄增长，皮肤的各种生理变化导致黑色素细胞相关情况改变。
皮肤损伤：皮肤受到外伤等损伤后，在修复过程中可能会导致黑色素细胞异常分布，进而形成黑痣。比如脸部曾经有过擦伤、划伤等外伤，在伤口愈合过程中，黑色素细胞可能没有正常分布，而是聚集形成黑痣。皮肤损伤破坏了原本皮肤的正常结构和黑色素细胞的分布状态，使得局部黑色素细胞异常聚集形成可见的黑痣。
