两只眼睛高低不一样可能由先天因素（如先天性上睑下垂等）和后天因素（眼部疾病、外伤、不良用眼习惯等）导致，需通过眼科检查（视力、眼部外观、眼球运动、影像学等检查）进行诊断，处理措施包括非手术干预（纠正用眼习惯、视觉训练等轻度情况）和手术干预（眼部结构异常明显影响外观或视功能时，根据情况选择合适手术方式），儿童出现需及时就诊保障视觉发育，成人出现需及时检查并依情况处理。
先天因素：部分婴儿在胚胎发育过程中出现眼部相关结构发育异常，如先天性上睑下垂等情况，这可能与遗传因素或胚胎早期环境等多种复杂因素相关，一些遗传综合征等可能导致双眼睑等结构发育不对称。
后天因素：
眼部疾病：如单侧眼部的重症肌无力等疾病影响眼部肌肉功能，进而导致眼睑等结构位置异常，重症肌无力可影响眼部肌肉神经-肌肉接头传递，导致眼睑等运动异常。
外伤：单侧眼部受到外伤，如眼部周围组织损伤，可能影响眼睑或眼球等结构位置，例如眼部周围骨折等情况可能改变眼部结构位置关系。
不良用眼习惯：长期单侧眼部过度用眼疲劳等，虽然相对影响程度较轻，但长期单侧睡眠姿势不当等也可能在一定程度上影响眼部周围肌肉等情况，不过这种相对影响一般程度较轻但也需关注。
相应检查与诊断
眼科检查：
视力检查：通过视力表等检查双眼视力情况，了解是否因视力差异等导致双眼视物情况不同进而影响眼部姿势等，例如如果单眼视力极差，可能会导致头部姿势代偿等情况。
眼部外观检查：观察眼睑、眼球等外观情况，查看是否有明显的结构异常，如眼睑下垂程度等情况。
眼球运动检查：通过眼球运动相关检查设备，了解眼球运动功能是否正常，如是否存在单侧眼球运动受限等情况。
影像学检查：对于眼部周围骨骼等情况，可进行眼部周围骨骼的影像学检查，如CT等，了解是否有骨骼结构异常导致眼部位置异常。
处理措施
非手术干预：
对于轻度情况：如果是因不良用眼习惯等导致的轻度双眼位置差异，可通过纠正用眼习惯等，如保持正确睡眠姿势等，部分可能得到改善，但需长期坚持。
视觉训练：如果与视力差异等相关，可在专业医生指导下进行视觉训练，例如对于因双眼视力差异导致的头部代偿姿势等情况，通过视觉训练调整双眼视力平衡等情况。
手术干预：
手术适应证：当眼部结构异常明显影响外观或视功能等，如先天性上睑下垂明显影响外观及视功能时，可考虑手术，例如先天性上睑下垂明显遮盖瞳孔影响视力发育时需考虑手术矫正。
手术方式选择：根据具体眼部结构异常情况选择合适手术方式，如对于上睑下垂可选择上睑下垂矫正手术等，手术需由经验丰富的眼科医生进行操作，充分评估手术风险及收益等情况。
特殊人群注意事项
儿童：儿童时期如果出现双眼位置差异，需特别关注，因为儿童眼部还在发育中，例如先天性因素导致的双眼位置差异，可能影响视觉发育关键期视觉发育异常，需及时就诊检查，一旦发现异常尽早干预，以保障儿童正常视觉发育。
成人：成人出现双眼位置差异，需考虑是否有眼部疾病等因素，如外伤等导致，需及时进行眼科相关检查，根据具体情况进行相应处理，若涉及手术等情况，需充分评估自身身体状况等因素。
