阿莫西林对细菌感染引起的扁桃体炎有用，对病毒感染无效。
阿莫西林是一种广谱青霉素类抗生素，通过抑制细菌细胞壁合成来破坏细菌结构，从而达到杀菌效果。扁桃体炎主要由病原微生物感染所致，其中细菌感染以乙型溶血性链球菌最为常见，肺炎链球菌、葡萄球菌等也可致病。当扁桃体炎由这些敏感菌引起时，阿莫西林可迅速作用于病原体，减轻炎症反应，缓解咽喉疼痛、红肿、吞咽困难等症状，缩短病程。
然而，若扁桃体炎由腺病毒、流感病毒等病毒感染引起，使用阿莫西林则无效，因为抗生素对病毒无抑制作用，此时应采取对症治疗缓解症状。此外，部分患者可能对阿莫西林过敏，用药前必须进行皮试，阳性者需禁用，并选择其他抗菌药物替代治疗。
