阴茎扭转的发生与胚胎发育异常、遗传因素、外界因素影响有关，胚胎期尿道海绵体发育异常可致其发生，部分遗传因素可能增加风险，胎儿期机械因素、孕期用药等外界因素也有影响，儿童及成年患者发现异常应及时就医，孕期要避免不良因素降低风险
一、胚胎发育异常
在胚胎发育过程中，阴茎的正常旋转与尿道海绵体的发育密切相关。如果胚胎期尿道海绵体发育出现异常，可能影响阴茎的正常扭转，导致阴茎扭转的发生。例如，在胚胎早期的特定阶段，相关组织的分化、迁移等过程出现偏差，就可能致使阴茎扭转的结构基础出现问题。
二、遗传因素
部分研究表明，遗传因素可能在阴茎扭转的发病中起到一定作用。某些特定的基因变异可能会影响阴茎发育过程中的相关生物学路径，增加阴茎扭转发生的风险。有家族史的人群相对来说，其后代发生阴茎扭转的概率可能较无家族史人群有所升高，但具体的遗传模式还需要进一步深入研究来明确。
三、外界因素影响
1.胎儿期机械因素：在胎儿发育的子宫内环境中，如果存在一些机械性的因素，比如子宫内空间狭小、胎儿体位异常且长时间保持某一不当姿势等，可能会对阴茎的正常发育产生机械性的压迫或影响，干扰阴茎的正常扭转过程，从而增加阴茎扭转的发生几率。
2.孕期用药及其他因素：孕妇在孕期如果接触到一些不良的物质，如某些可能影响胚胎发育的药物、化学物质等，或者有感染等情况，也可能会对胎儿阴茎的发育产生不良影响，进而与阴茎扭转的发生相关。不过这类因素相对遗传和胚胎发育异常等因素来说，其影响机制相对复杂且需要更多的研究来确切阐明关联程度。
对于儿童患者，家长需密切关注孩子阴茎发育情况，若发现异常应及时就医；对于成年患者，若出现阴茎扭转相关不适等情况也应尽早到泌尿外科等相关科室就诊，以便明确诊断并采取合适的处理措施。同时，在孕期要尽量避免接触可能影响胎儿发育的不良因素，做好孕期保健等工作，降低胎儿出现阴茎扭转等发育异常的风险。
