室间隔缺损的发生与遗传因素、环境因素及其他因素有关，遗传因素方面某些基因突变及家族遗传病史会增加风险；环境因素包括母体孕期感染、接触有害物质、不良生活习惯等影响胎儿心脏发育；其他因素有早产及低出生体重也会使发生室间隔缺损几率升高
一、遗传因素
室间隔缺损具有一定的遗传易感性。研究表明，某些基因突变可能增加室间隔缺损的发生风险。例如，一些与心脏发育相关的基因发生突变时，可能干扰心脏在胚胎发育时期的正常形成过程，导致室间隔部位出现缺损。在有家族遗传病史的人群中，后代患室间隔缺损的概率相对较高。比如，若家族中有直系亲属曾患有室间隔缺损，那么其后代发生该疾病的可能性会比普通人群有所提升。
二、环境因素
1.母体孕期感染：母亲在孕期尤其是妊娠早期感染某些病毒，如风疹病毒等，可能影响胎儿心脏的发育。病毒感染会干扰胚胎心脏的正常分化和融合过程，使得室间隔的形成出现障碍，进而引发室间隔缺损。例如，孕妇在妊娠前3个月内感染风疹病毒，胎儿患室间隔缺损等心脏畸形的几率会显著增加。
2.母体孕期接触有害物质：孕期接触某些有害物质，像放射性物质、某些化学毒物等，也可能对胎儿心脏发育产生不良影响。放射性物质会损伤胚胎细胞的遗传物质和正常发育进程，化学毒物可能干扰心脏发育相关的生化代谢途径，从而增加室间隔缺损的发生风险。例如，长期处于高浓度农药环境中的孕妇，其胎儿发生心脏畸形包括室间隔缺损的可能性较正常环境下的孕妇更高。
3.孕期不良生活习惯：孕妇孕期吸烟、酗酒等不良生活习惯也与室间隔缺损的发生有关。吸烟产生的尼古丁等有害物质会通过胎盘影响胎儿的血液循环和发育，酗酒则可能导致胎儿营养吸收障碍以及体内代谢紊乱，进而干扰心脏的正常发育，增加室间隔缺损的发生几率。
三、其他因素
1.早产：早产儿由于其身体各器官包括心脏的发育尚未完全成熟，尤其是心脏的间隔结构可能还未发育完善，所以发生室间隔缺损等心脏畸形的概率相对足月儿更高。这是因为早产时胎儿在母体内的发育时间不足，心脏的正常分化、融合等过程未能充分完成。
2.低出生体重：低出生体重儿往往在胚胎发育阶段就存在一定的营养供应不足等问题，影响心脏的正常发育，使得室间隔缺损等心脏结构异常的发生风险增加。低出生体重会导致胎儿获取的营养物质相对较少，而心脏发育需要充足的营养支持，营养不足就可能引发心脏结构的缺陷。
