室间隔缺损的发生与多种因素有关，包括遗传因素（染色体异常相关及单基因遗传突变）、胚胎发育时期的环境因素（母体感染、接触有害物质、患母体疾病等）以及其他因素（早产、低出生体重），遗传因素可致染色体或基因异常影响心脏发育，环境因素中母体感染、接触有害物质、患某些疾病会干扰胎儿心脏发育，早产和低出生体重也会增加室间隔缺损风险。
一、遗传因素
1.染色体异常相关：某些染色体数目或结构的异常可能与室间隔缺损的发生有关。例如，21-三体综合征（唐氏综合征）患儿常伴有室间隔缺损等心血管畸形，研究发现其染色体上特定基因的异常改变会影响心脏发育过程中的相关信号通路，导致室间隔在胚胎发育时期不能正常融合形成完整的间隔，从而引发室间隔缺损。
2.单基因遗传突变：已发现一些单基因的遗传突变与室间隔缺损相关。比如，编码心脏发育相关蛋白的基因发生突变时，会干扰心脏胚胎发育过程中的细胞分化、增殖和迁移等关键环节，使得室间隔的形成出现障碍，进而导致室间隔缺损的发生。这种遗传因素导致的室间隔缺损往往具有家族聚集性，在有家族遗传病史的宝宝中更易出现。
二、胚胎发育时期的环境因素
1.母体感染：
病毒感染：孕期母亲感染风疹病毒、巨细胞病毒等。例如，孕期感染风疹病毒后，病毒可通过胎盘影响胎儿心脏的发育，在胚胎发育的关键时期（一般为受孕后的2-8周是心脏发育的重要阶段），病毒会干扰心脏原始心管的分隔等过程，导致室间隔缺损。研究表明，母体在孕期感染风疹病毒后，胎儿患室间隔缺损等心血管畸形的风险显著增加。
其他病原体感染：母体感染弓形虫等病原体也可能对胎儿心脏发育产生不良影响，引起室间隔缺损。
2.母体接触有害物质：
药物因素：孕期母亲不合理使用某些药物，如抗肿瘤药物、抗癫痫药物等。一些抗肿瘤药物在抑制肿瘤细胞生长的同时，也可能干扰胎儿心脏的正常发育，导致室间隔缺损等畸形。抗癫痫药物中的丙戊酸等，在孕期使用可能会影响胎儿心脏的胚胎发育过程，增加胎儿发生室间隔缺损的概率。
化学物质：孕期母亲长期接触有机溶剂、铅等化学物质。例如，长期处于含有较高浓度有机溶剂的工作环境或生活环境中，有机溶剂可能通过胎盘进入胎儿体内，干扰心脏发育相关的细胞代谢和信号传导，从而引发室间隔缺损。铅等重金属的接触也会对胎儿心脏发育造成损害，影响室间隔的正常形成。
放射线：孕期母亲接受过大剂量的放射线暴露，如在进行放射性治疗或意外受到高剂量辐射时，放射线会破坏胎儿心脏发育的相关细胞，影响心脏的正常结构形成，导致室间隔缺损等心血管畸形的发生风险升高。
3.母体疾病因素：
糖尿病：孕期母亲患有未控制良好的糖尿病，高血糖环境会影响胎儿的代谢和发育。胎儿在高血糖环境下，胰岛素分泌增加，导致细胞增殖和分化异常，进而影响心脏的发育，增加室间隔缺损等心血管畸形的发生几率。研究显示，孕期糖尿病母亲所生的宝宝患室间隔缺损的风险明显高于正常血糖母亲所生的宝宝。
其他慢性疾病：孕期母亲患有如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病时，自身免疫反应可能会波及胎儿心脏，影响心脏的正常发育过程，引发室间隔缺损。
三、其他因素
1.早产：早产的宝宝由于其心脏等器官的发育尚未完全成熟，在胚胎发育阶段可能受到的影响更多，发生室间隔缺损等心血管畸形的风险相对较高。早产时胎儿的心脏结构形成过程可能受到干扰，导致室间隔在发育过程中出现缺陷。
2.低出生体重：低出生体重的宝宝往往在胚胎发育时期营养供应等方面存在一定问题，心脏发育可能受到影响，从而增加了室间隔缺损的发生风险。低出生体重意味着胎儿在子宫内的生长发育可能受到限制，心脏发育相关的细胞增殖、分化等过程可能不能正常完成，导致室间隔缺损等情况出现。
