小便的时候龟头有点疼的原因可能包括尿路感染、龟头炎、尿道结石、性传播疾病、外伤等。
1、尿路感染
尿路感染是导致小便时龟头疼痛的常见原因之一。当细菌侵入尿道并上行感染至膀胱等部位时，会引发炎症。炎症刺激尿道黏膜，使尿道变得敏感，在排尿过程中，尿液对受损黏膜产生刺激，就会引起龟头部位的疼痛，还可能伴有尿频、尿急等症状。
2、龟头炎
龟头炎多因包皮过长、不注意局部卫生或感染等因素引起。炎症会导致龟头皮肤红肿、糜烂，在排尿时，尿液接触到发炎的龟头组织，会刺激神经末梢，进而产生疼痛感，严重时可能会有分泌物渗出。
3、尿道结石
如果尿道内存在结石，排尿时尿液的流动会冲击结石，结石移动可能会刮伤尿道黏膜，或者卡在尿道狭窄处，阻碍尿液排出，导致尿道内压力升高，这些情况都会引起龟头部位的疼痛，疼痛程度可能因结石大小和位置而异。
4、性传播疾病
某些性传播疾病，如淋病、尖锐湿疣等，也可能导致小便时龟头疼痛。淋病由淋球菌感染引起，会使尿道出现化脓性炎症，排尿时有刺痛感；尖锐湿疣是病毒感染所致，疣体可能生长在龟头等部位，排尿时尿液刺激疣体，也会引起疼痛。
5、外伤
龟头部位受到外伤，比如擦伤、撞击伤等，会损伤局部组织。在排尿时，尿液对受伤部位产生刺激，就会引发疼痛。如果外伤较严重，还可能出现肿胀、出血等情况。
如果龟头疼痛症状持续不缓解，或者伴有发热、尿道流脓、血尿等异常情况，应及时就医，进行相关检查，如尿常规、尿道分泌物检测、超声等，以明确病因，并进行针对性治疗。
