小儿川崎病病因未完全明确，与多种因素有关，包括感染因素（病毒、细菌感染可能引发免疫反应异常致血管炎症）、免疫因素（免疫功能紊乱、遗传易感性起作用）、其他因素（环境因素可能有影响，婴幼儿因免疫系统未成熟易发病，要注意相关环境及关注有遗传易感性患儿）。
病毒感染：研究发现多种病毒可能与川崎病的发病相关，如逆转录病毒、柯萨奇病毒、EB病毒等。有研究表明，某些病毒感染后可能引发机体的免疫反应异常，从而导致川崎病的发生。例如，部分柯萨奇病毒感染后，可通过分子模拟机制，使机体免疫系统错误地攻击自身血管组织，引发血管炎症等一系列病理改变。
细菌感染：链球菌、葡萄球菌等细菌感染也被推测可能与川崎病有关。细菌感染后，其抗原成分可能作为外来刺激物，激活机体的免疫系统，导致免疫细胞的异常活化和细胞因子的大量释放，进而引发血管的炎症反应。不过，具体的细菌感染途径和机制还需要进一步深入研究来明确。
免疫因素：
患儿体内存在明显的免疫功能紊乱。在川崎病发病时，免疫系统中的T细胞、B细胞等免疫细胞异常活化，产生大量的细胞因子和炎症介质，如白细胞介素-1、白细胞介素-6、肿瘤坏死因子等。这些炎症介质会导致血管内皮细胞损伤，引起血管炎症，表现为发热、皮疹、结膜充血、口唇皲裂、手足硬性水肿等一系列临床症状。例如，大量的白细胞介素-6可以促进炎症的发展，进一步加重血管的炎症反应程度。
遗传易感性也在小儿川崎病的发病中起到一定作用。研究发现，某些基因多态性与川崎病的易感性相关。具有特定基因变异的个体，在相同的感染等外界因素刺激下，更容易发生免疫反应的异常，从而增加患川崎病的风险。不同种族和地区的人群中，川崎病的发病率存在差异，也从侧面提示了遗传因素与环境因素相互作用在发病中的重要性。
其他因素：
环境因素也可能对小儿川崎病的发病有影响。例如，某些化学物质、环境污染等可能通过影响机体的免疫功能或直接损伤血管内皮细胞，增加川崎病的发病几率。不过，目前关于环境因素与川崎病关系的研究还相对较少，需要进一步开展大规模的流行病学调查和基础研究来明确具体的环境致病因素及其作用机制。对于婴幼儿来说，由于其免疫系统尚未完全发育成熟，对外界因素的抵抗力较弱，更容易受到各种因素的影响而诱发川崎病。在生活中，要注意保持婴幼儿生活环境的清洁和卫生，减少可能的环境致病因素接触。同时，对于有家族遗传易感性的患儿家属，更要密切关注患儿的健康状况，一旦出现疑似川崎病的症状，应及时就医诊断。
