植物神经官能症可引发心血管系统、消化系统、呼吸系统、神经系统、泌尿生殖系统等多系统症状，如心血管系统的心悸等，消化系统的食欲缺乏等，呼吸系统的胸闷气短等，神经系统的头痛头晕等，泌尿生殖系统的女性月经不调、男性遗精阳痿等，还可出现多汗、手脚麻木发凉等其他症状，不同年龄人群及有基础病史者表现有差异或影响不同。
一、心血管系统症状
植物神经官能症患者在心血管系统方面可出现心悸，即自觉心跳或心慌，可伴有心前区不适，动态心电图等检查可能发现心率失常等情况，部分患者心率可在静息状态下增快，年龄较轻者可能因交感神经相对兴奋更易出现此类表现，若有基础心血管病史者可能会加重原有病情相关的不适感觉。
二、消化系统症状
常表现为食欲缺乏，进食量减少，有的患者会出现腹胀、腹痛等不适，疼痛部位不固定，疼痛性质多样，可能为隐痛、胀痛等。不同年龄人群表现可能有差异，儿童可能影响生长发育相关指标，比如体重增长缓慢等，这与植物神经功能紊乱影响胃肠蠕动及消化液分泌有关，生活方式不规律者更易出现消化系统症状加重情况。
三、呼吸系统症状
可出现胸闷、气短，患者主观感觉空气不足，需深呼吸或叹气样呼吸以缓解症状。青少年时期由于身心发育变化，可能因情绪波动等因素更易诱发呼吸系统症状，而有慢性呼吸系统病史者可能会使原有病情评估更复杂，比如原本哮喘患者可能因植物神经功能紊乱导致哮喘发作频率改变等。
四、神经系统症状
常见头痛、头晕，头痛多为胀痛、隐痛等，部位不固定；头晕可表现为头重脚轻感。中老年人群由于自身脑血管调节功能可能逐渐减退，更易受植物神经功能紊乱影响出现头晕等症状，长期精神紧张、压力大的生活方式会加重神经系统症状的程度。
五、泌尿生殖系统症状
女性可能出现月经不调，表现为月经周期紊乱、经量异常等；男性可能有遗精、阳痿等表现。不同性别在激素水平等生理差异基础上，植物神经功能紊乱对泌尿生殖系统影响不同，有妇科病史或男科病史者植物神经功能紊乱可能会干扰原有疾病的恢复进程，比如本身有多囊卵巢综合征的女性，植物神经功能紊乱可能进一步影响月经及内分泌状态。
六、其他症状
还可出现多汗，表现为全身或局部出汗异常，比如手心、脚心多汗等，有的患者会有手脚麻木、发凉等感觉异常。不同年龄人群出汗异常对生活影响不同，儿童可能因手脚多汗影响手部精细动作及脚部舒适感，生活方式中接触刺激性物质等情况可能加重出汗等异常表现。
