长年失眠与神经系统、心血管系统、免疫系统相关疾病密切关联，长期失眠会增加阿尔茨海默病风险、干扰神经递质致抑郁焦虑，通过多种机制致高血压、增冠心病风险，还会干扰免疫功能致免疫力下降易感染等，不同人群受影响情况有差异。
抑郁和焦虑障碍：失眠与抑郁、焦虑之间存在密切的双向关联。长年失眠会使大脑中的神经递质失衡，例如5-羟色胺、去甲肾上腺素等神经递质水平异常。5-羟色胺具有调节情绪的作用，长期失眠导致其分泌减少，会增加抑郁和焦虑的发生风险。而抑郁和焦虑患者往往也伴有失眠症状，形成恶性循环。生活方式不规律、长期处于压力状态的人群，长年失眠后更易陷入抑郁和焦虑的情绪困境，比如一些工作压力大、经常熬夜的上班族，长年失眠后可能逐渐出现情绪低落、对事物缺乏兴趣等抑郁表现，或者经常处于紧张、担忧的焦虑状态。
心血管系统相关疾病
高血压：长年失眠会通过多种机制影响血压。失眠状态下，人体的交感神经系统处于持续兴奋状态，导致去甲肾上腺素等交感神经递质分泌增加，引起血管收缩，外周阻力增大，从而使血压升高。研究发现，长期失眠者患高血压的几率比睡眠正常人群高约30%。对于有家族高血压病史的人群，长年失眠会进一步加重血压的波动，使血压更难控制。男性和女性在长年失眠影响高血压发病方面可能没有明显性别差异，但有基础心血管疾病风险因素的人群，如肥胖、高血脂等，长年失眠对血压的不良影响更为显著。
冠心病：失眠会影响心血管系统的正常调节。长期失眠导致机体处于应激状态，炎症反应相关指标升高，如C-反应蛋白等。炎症反应会损伤血管内皮，促使动脉粥样硬化斑块形成，而动脉粥样硬化是冠心病的主要病理基础。另外，失眠引起的心率变异性降低，会使心脏的电活动不稳定，增加心律失常的发生风险，进而影响心脏的正常供血，增加冠心病的发病风险和不良心血管事件的发生几率。有吸烟、酗酒等不良生活方式的长年失眠人群，患冠心病的风险会大幅增加，因为这些不良生活方式本身就会对心血管系统造成损害，再加上长年失眠的叠加作用，危害更大。
免疫系统相关疾病
免疫力下降：长年失眠会干扰免疫系统的正常功能。睡眠是免疫系统修复和调节的重要时期，长期失眠会影响T淋巴细胞、B淋巴细胞等免疫细胞的功能和数量。例如，T淋巴细胞在机体的细胞免疫中起关键作用，长期失眠会导致T淋巴细胞的活性降低，使其识别和杀伤病原体的能力下降。这使得人体更容易受到病原体的侵袭，患上各种感染性疾病，如呼吸道感染等。老年人由于本身免疫力随年龄增长而下降，长年失眠会进一步削弱其免疫力，更容易频繁发生感染，且感染后恢复时间可能更长。女性在生理期、孕期等特殊生理时期，本身免疫力相对较低，长年失眠会使免疫力下降的情况雪上加霜，增加患病的可能性。
