神经母细胞瘤具体病因未完全明确，可能与遗传因素（部分与遗传突变有关，家族有相关遗传突变携带史后代发病概率高，不同年龄段受遗传因素影响不同）、胚胎发育异常（胚胎发育中神经嵴细胞正常迁移分化异常可致发病，胚胎发育关键阶段受不利因素干扰发病几率升高）、表观遗传因素（表观遗传修饰异常参与发病，基因表达调控受影响，不同生活方式人群发病风险不同，儿童因生长发育阶段表观遗传系统易受干扰需重点关注）、其他环境因素（孕期母体接触化学物质、辐射等及母亲孕期生活方式可能相关，年龄小儿童对环境因素抵御弱，母亲孕期暴露不良环境因素儿童发病可能性高）相关
遗传因素：部分神经母细胞瘤与遗传突变有关。例如，一些基因的异常改变可能增加发病风险。有家族性神经母细胞瘤病例报道，若家族中有相关遗传突变携带史，后代患神经母细胞瘤的概率相对较高。从遗传学角度看，某些特定染色体的畸变或基因的缺失、突变等情况，会影响细胞的正常生长、分化调控，使得神经嵴来源的细胞异常增殖，进而引发神经母细胞瘤。不同年龄段的人群，若存在家族遗传易感性，发病风险会有所不同，儿童尤其是婴幼儿相对更易受遗传因素影响而发病。
胚胎发育异常：在胚胎发育过程中，神经嵴细胞的正常迁移、分化过程出现异常可能导致神经母细胞瘤。神经嵴细胞会分化为交感神经系统等多种组织细胞，若在分化过程中出现紊乱，部分细胞异常增殖并留存，就可能发展为神经母细胞瘤。胚胎发育阶段受到一些不利因素干扰时，比如母体在孕期接触某些不良环境因素等，可能影响胚胎神经嵴细胞的正常发育，增加神经母细胞瘤的发生几率。对于处于胚胎发育关键阶段的胎儿，其发生神经母细胞瘤的潜在风险会因胚胎发育异常相关因素而升高。
表观遗传因素：表观遗传修饰的异常也可能参与神经母细胞瘤的发生。DNA甲基化、组蛋白修饰等表观遗传机制的紊乱，会影响基因的表达调控。例如，某些基因的启动子区域甲基化状态改变，导致基因表达异常，进而影响细胞的生物学行为，促使神经母细胞瘤的发生发展。不同生活方式的人群，表观遗传修饰受外界因素影响不同，比如长期暴露于污染环境、不良饮食习惯等，可能通过影响表观遗传机制增加神经母细胞瘤发病风险，儿童由于身体处于生长发育阶段，表观遗传系统相对更易受外界因素干扰，发病风险相对需重点关注。
其他环境因素：孕期母体接触某些化学物质、辐射等环境因素可能与神经母细胞瘤发生有关。例如，长期接触某些工业污染物、农药等，可能增加胎儿患神经母细胞瘤的风险。母亲在孕期的生活方式，如是否吸烟、饮酒等，也可能对胎儿发育产生影响，进而与神经母细胞瘤的发生相关。年龄较小的儿童，由于其身体对环境因素的抵御能力较弱，若母亲在孕期暴露于上述不良环境因素，儿童患神经母细胞瘤的可能性相对更高。
