急性肾盂肾炎有全身症状、泌尿系统症状和胃肠道症状。全身症状包括突然起病、体温迅速升高至38℃以上甚至更高的发热，常与高热同时出现的寒战，以及全身不适、乏力；泌尿系统症状有膀胱刺激征表现的尿频、尿急、尿痛，单侧或双侧腰部胀痛或酸痛的腰痛，还有血尿、蛋白尿、脓尿等尿液异常；部分患者有恶心、呕吐、食欲不振等胃肠道症状，儿童和老年患者症状表现各有特点。
发热：多为突然起病，体温可迅速升高至38℃以上，甚至可达39℃-40℃，呈弛张热或稽留热型，部分患者可伴有寒战，这是由于细菌感染引发机体的炎症反应，导致体温调节中枢功能紊乱所致。对于儿童而言，发热可能更为突出且体温波动较大，因为儿童的体温调节机制尚不完善，感染后更容易出现高热情况；而老年患者发热可能相对不典型，体温升高幅度可能不如青壮年明显，但仍需密切关注，因为老年患者免疫力相对较低，感染可能更容易扩散。
寒战：常与高热同时出现，是机体对细菌内毒素等致热物质的一种强烈反应，寒战发生时患者会感觉寒冷、发抖，此时体表血管收缩，后续可能出现散热增加而导致体温进一步上升。
全身不适、乏力：患者会感到全身疲倦、没有力气，活动耐力明显下降，这是因为细菌感染引起机体代谢紊乱，消耗大量能量，同时炎症介质的释放也会影响机体的正常生理功能。
泌尿系统症状
尿频、尿急、尿痛：此为膀胱刺激征，是急性肾盂肾炎常见的泌尿系统表现。由于炎症刺激膀胱黏膜，导致膀胱敏感性增高，患者会频繁产生尿意，即尿频；同时难以控制排尿，出现尿急；排尿时尿道有烧灼感或疼痛，即尿痛。儿童患者可能表达不准确，需要家长观察其排尿时的异常表现，如哭闹、搔抓会阴部等；老年患者由于可能同时存在前列腺增生等其他泌尿系统问题，尿频、尿急、尿痛的表现可能不典型，但仍需重视。
腰痛：多为单侧或双侧腰部胀痛或酸痛，疼痛程度不一。肾脏包膜受到炎症刺激或肾脏肿大牵拉包膜时会引起腰痛，疼痛部位通常在肋脊角或腰部，部分患者可沿输尿管放射至下腹部。儿童患者可能无法准确描述腰痛位置，可能表现为哭闹、拒按腰部等；老年患者腰痛可能与本身存在的腰椎病变等情况混淆，需要结合其他症状综合判断。
尿液异常：可出现血尿，尿液外观呈洗肉水样或镜下可见红细胞增多；也可出现蛋白尿，尿常规检查可发现尿蛋白阳性，但一般为轻度蛋白尿；还可能出现脓尿，尿中白细胞明显增多，离心尿沉渣镜检白细胞数＞5个/高倍视野，这是由于炎症导致泌尿系统黏膜充血、渗出，白细胞聚集所致。
胃肠道症状
部分患者可出现恶心、呕吐、食欲不振等胃肠道症状，这是因为肾脏炎症刺激可通过神经反射引起胃肠道功能紊乱，同时发热等全身症状也会影响消化功能。儿童患者由于胃肠道功能相对较弱，恶心、呕吐等胃肠道症状可能更为明显；老年患者本身消化功能可能减退，加上感染的影响，胃肠道症状可能会加重患者的不适。
