生化妊娠受多种因素影响，包括染色体异常（胚胎染色体数目或结构异常，高龄孕妇更常见）、子宫因素（子宫解剖结构异常如畸形、子宫内膜厚度、容受性异常等）、内分泌因素（黄体功能不全、甲状腺功能异常）、免疫因素（自身免疫异常如抗磷脂抗体综合征、同种免疫异常）以及其他因素（生活方式如吸烟酗酒、精神心理因素如长期高压力）
一、染色体异常
染色体异常是导致生化妊娠的重要原因之一。正常受孕需要精子和卵子的染色体都正常，若胚胎染色体存在数目或结构异常，就容易发生生化妊娠。例如，大量研究表明，在自然流产的胚胎中，约50%-60%存在染色体异常，而生化妊娠与胚胎染色体异常密切相关，这种情况在高龄孕妇中更为常见，因为随着年龄增长，卵子质量下降，染色体异常的概率增加。
二、子宫因素
1.子宫解剖结构异常：如子宫畸形（像单角子宫、双角子宫等），会影响胚胎的着床和发育环境。子宫畸形会使宫腔形态异常，胚胎着床后可能因为宫腔空间不足或血供异常等原因导致生化妊娠。例如，有研究发现子宫畸形患者生化妊娠的发生率高于正常子宫的女性。
2.子宫内膜因素：子宫内膜的厚度和容受性对胚胎着床至关重要。子宫内膜过薄（一般认为厚度小于7mm可能影响着床）或过厚、子宫内膜炎等情况都可能引发生化妊娠。子宫内膜容受性是指子宫内膜允许胚胎着床的能力，若子宫内膜的细胞因子、激素受体等出现异常，会影响胚胎与子宫内膜的相互作用，导致生化妊娠。
三、内分泌因素
1.黄体功能不全：黄体分泌的孕酮等激素对维持妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕酮分泌不足，就无法为胚胎着床和早期发育提供良好的内分泌环境，从而增加生化妊娠的风险。多项研究显示，黄体功能不全的女性生化妊娠发生率明显高于黄体功能正常的女性。
2.甲状腺功能异常：甲状腺激素参与人体的新陈代谢等多种生理过程，与生殖系统功能密切相关。甲状腺功能减退或亢进都可能影响妊娠。甲状腺功能减退时，机体内分泌紊乱，会干扰胚胎的着床和发育；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会对妊娠产生不良影响，增加生化妊娠的可能性。
四、免疫因素
1.自身免疫异常：例如抗磷脂抗体综合征，患者体内存在抗磷脂抗体，会影响胎盘的血管形成，导致胎盘血流灌注不足，进而影响胚胎的发育，引发生化妊娠。相关研究表明，抗磷脂抗体阳性的女性生化妊娠发生率较阴性者显著升高。
2.同种免疫异常：母体对胚胎的免疫排斥反应异常也可能导致生化妊娠。正常妊娠时，母体免疫系统对胚胎有一定的免疫耐受，但如果这种免疫耐受失衡，母体免疫系统攻击胚胎，就会造成生化妊娠。
五、其他因素
1.生活方式：长期吸烟、酗酒等不良生活方式会影响生殖健康。吸烟会损害卵子和精子的质量，影响染色体的稳定性，增加胚胎染色体异常的概率，从而提高生化妊娠的风险；酗酒会干扰内分泌系统，影响激素水平，不利于胚胎的着床和发育。
2.精神心理因素：长期处于高压力状态下，会导致内分泌失调，影响生殖激素的分泌，进而影响妊娠结局，增加生化妊娠的发生几率。例如，有研究发现精神压力过大的女性生化妊娠发生率高于精神压力较小的女性。
