生化妊娠受多种因素影响，包括染色体因素（如染色体数目或结构异常、年龄致染色体异常概率增加）、子宫因素（解剖结构异常、内膜因素）、内分泌因素（黄体功能不全、甲状腺功能异常）、免疫因素（自身免疫异常、同种免疫异常）、生活方式因素（吸烟饮酒、过度肥胖或消瘦、压力过大）及其他因素（感染因素、反复流产史）。
一、染色体因素
染色体异常是导致生化妊娠的重要原因之一。染色体数目或结构的异常会影响受精卵的正常发育。例如，夫妻双方任何一方存在染色体数目异常，如三体综合征等情况，或者染色体结构异常，如平衡易位等，都可能使受精卵无法正常着床和发育，从而引发生化妊娠。从年龄角度来看，女性年龄越大，卵子质量下降，染色体异常的概率增加，发生生化妊娠的风险也相应升高；男性随着年龄增长，精子染色体异常的可能性也会增大。
二、子宫因素
1.子宫解剖结构异常：如子宫畸形，像单角子宫、双角子宫等，子宫的形态异常会影响受精卵的着床环境。子宫黏膜下肌瘤会占据宫腔内空间，改变子宫内的微环境，阻碍受精卵着床，进而导致生化妊娠。
2.子宫内膜因素：子宫内膜厚度不合适，过薄或过厚都不利于受精卵着床。过薄的子宫内膜无法为受精卵提供良好的营养支持和着床条件；过厚则可能存在内膜病变等问题。子宫内膜容受性降低也会影响受精卵着床，例如子宫内膜细胞表面的一些受体表达异常等情况，会使受精卵难以成功着床，引发生化妊娠。
三、内分泌因素
1.黄体功能不全：黄体分泌的孕酮不足会影响子宫内膜的转化，使得子宫内膜不利于受精卵着床。研究表明，黄体期孕酮水平低于正常范围时，生化妊娠的发生率会增加。女性自身的内分泌调节系统出现问题，如垂体-卵巢轴功能异常等，都可能导致黄体功能不全。
2.甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进都会对妊娠产生影响。甲状腺激素参与身体的代谢调节，甲状腺功能减退时，机体代谢率降低，可能影响子宫内膜的容受性以及胚胎的发育；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰正常的妊娠过程，增加生化妊娠的风险。
四、免疫因素
1.自身免疫异常：体内存在抗磷脂抗体等自身抗体时，会影响胎盘的血管形成，导致胎盘供血不足，从而影响胚胎的发育，引发生化妊娠。自身免疫性疾病患者，如系统性红斑狼疮等，自身免疫紊乱更容易出现这种情况。
2.同种免疫异常：母体对胚胎的免疫耐受异常，母体免疫系统将胚胎视为异物进行攻击，也会导致生化妊娠。例如，一些母体的自然杀伤细胞活性过高等免疫状态异常情况，会影响胚胎的着床和发育。
五、生活方式因素
1.吸烟饮酒：女性吸烟会影响卵子质量和输卵管的功能，男性吸烟会降低精子质量。饮酒会干扰体内的激素水平和生殖系统的正常功能。长期吸烟饮酒的人群发生生化妊娠的概率比不吸烟饮酒的人群要高。
2.过度肥胖或消瘦：过度肥胖会影响内分泌系统，导致激素水平失衡，增加胰岛素抵抗等问题，进而影响妊娠；过度消瘦则可能存在营养不良等情况，影响身体的正常生殖内分泌功能，都可能引发生化妊娠。
3.压力过大：长期处于高压力状态下，会使体内分泌过多的应激激素，如皮质醇等，干扰正常的内分泌调节，影响排卵、受精以及受精卵的着床过程，增加生化妊娠的风险。
六、其他因素
1.感染因素：一些生殖道感染，如支原体、衣原体感染等，会影响子宫和输卵管的环境，导致炎症反应，干扰受精卵的着床和发育，从而引发生化妊娠。
2.反复流产史：有反复流产史的女性，子宫内膜可能受到损伤，子宫内环境改变，同时身体的内分泌和免疫等系统可能存在一定的紊乱，再次妊娠时发生生化妊娠的可能性增加。
