肚子疼、拉肚子的原因包括感染性因素和非感染性因素。感染性因素有病毒感染（轮状病毒、诺如病毒）和细菌感染（大肠杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌）；非感染性因素包括饮食因素（食物过敏、饮食不当）、肠道疾病（炎症性肠病、肠易激综合征）以及其他系统疾病累及肠道（甲状腺功能亢进、肝胆疾病）。
一、感染性因素
1.病毒感染：
轮状病毒：多见于婴幼儿，是引起婴幼儿腹泻的常见病原体之一。主要通过粪-口途径传播，秋冬季节为高发期。患者感染后，病毒在小肠绒毛上皮细胞内复制，导致细胞功能受损，影响肠道对水分和电解质的吸收，引起腹泻，常伴有呕吐、发热等症状。研究表明，轮状病毒感染可使肠道黏膜绒毛萎缩、变短，微绒毛破坏，从而影响消化和吸收功能。
诺如病毒：全年均可发生感染，人群普遍易感，常引起集体单位和学校等场所的暴发流行。诺如病毒感染人体后，主要侵犯小肠上皮细胞，导致肠道功能紊乱，引起腹泻，多为水样便，同时可伴有恶心、呕吐、腹痛等症状。其传播途径包括食用被诺如病毒污染的食物、饮用被污染的水，以及接触被污染的物体表面后再接触口等。
2.细菌感染：
大肠杆菌：某些类型的大肠杆菌如产毒性大肠杆菌可引起腹泻。该菌可产生肠毒素，作用于肠上皮细胞，导致肠液分泌增加，吸收减少，引起腹泻。常通过污染的食物和水传播，儿童和老年人等人群易感染，症状可为水样便、腹痛等。例如，在一些卫生条件较差的地区，食用被产毒性大肠杆菌污染的食物后，容易出现腹泻症状。
沙门氏菌：沙门氏菌感染也是导致肚子疼、拉肚子的常见细菌感染原因。患者食用被沙门氏菌污染的肉类、蛋类等食物后发病，细菌在肠道内繁殖，引起肠道炎症反应，导致腹泻，常伴有发热、腹痛、恶心、呕吐等症状。不同年龄段人群均可感染，但儿童和免疫力低下者感染后病情可能相对较重。
志贺氏菌：志贺氏菌引起的菌痢是常见的肠道传染病，主要通过粪-口途径传播。志贺氏菌侵入肠道黏膜上皮细胞并繁殖，引起黏膜炎症、坏死和溃疡，导致腹泻，多为黏液脓血便，同时伴有腹痛、里急后重等症状，儿童感染相对较为常见，且病情可能发展较快。
二、非感染性因素
1.饮食因素：
食物过敏：部分人对某些食物过敏，如牛奶、海鲜等。当食用过敏食物后，机体发生免疫反应，累及胃肠道时可出现肚子疼、拉肚子的症状，还可能伴有呕吐、皮疹、瘙痒等其他过敏表现。例如，对牛奶过敏的婴幼儿，在饮用牛奶后可能很快出现腹泻、腹胀、哭闹不安等症状。
饮食不当：短期内大量食用生冷、辛辣、油腻食物，可刺激胃肠道，导致胃肠功能紊乱，引起腹泻、腹痛。比如，过量食用冰淇淋后，寒冷刺激胃肠道，使肠道蠕动加快，出现拉肚子、肚子疼的情况；进食过多油炸食品，不易消化，加重胃肠负担，也可能引发胃肠道不适。
2.肠道疾病：
炎症性肠病：包括溃疡性结肠炎和克罗恩病。溃疡性结肠炎主要累及直肠和结肠，病变呈连续性、弥漫性分布，患者表现为反复发作的腹泻、黏液脓血便、腹痛，腹痛多为左下腹或下腹隐痛，还可伴有腹胀、食欲不振等症状。克罗恩病可累及胃肠道各部位，呈节段性分布，症状包括腹泻、腹痛、腹部包块、瘘管形成等，腹痛多为右下腹或脐周隐痛，病情容易反复发作，病程较长，对患者的生活质量影响较大，任何年龄段均可发病，但多见于青壮年。
肠易激综合征：这是一种常见的功能性肠病，病因尚不明确，可能与胃肠动力异常、内脏高敏感性、肠道感染后、精神心理因素等有关。患者主要表现为腹痛、腹泻，多在排便后缓解，还可伴有便秘与腹泻交替、腹胀等症状，症状可在应激状态下加重，各个年龄段均可发病，女性相对多见。
3.其他系统疾病累及肠道：
甲状腺功能亢进：甲状腺激素分泌过多，可使胃肠蠕动加快，消化吸收功能紊乱，患者出现腹泻、大便次数增多，同时伴有多汗、心慌、手抖、消瘦等症状。多见于中青年女性，由于甲状腺功能亢进影响了全身多个系统的功能，肠道也受到累及而出现相关症状。
肝胆疾病：如慢性胆囊炎、肝硬化等。慢性胆囊炎患者由于胆汁分泌和排泄异常，影响脂肪的消化吸收，进食油腻食物后容易出现腹痛、腹泻等消化不良症状；肝硬化患者肝功能减退，导致消化酶分泌减少，肠道对营养物质的吸收障碍，也可能出现腹泻，同时伴有乏力、黄疸、腹水等其他肝硬化相关表现。
