黄体功能不全的发生与内分泌、子宫内膜、自身免疫、生活方式、年龄、遗传等多种因素有关。内分泌方面下丘脑-垂体-卵巢轴功能异常及卵巢本身问题可致黄体功能不全；子宫内膜受体异常和容受性问题会受影响；自身免疫疾病、长期精神压力大、过度减肥等生活方式、年龄增长、遗传因素等也与之相关。
一、内分泌因素
1.下丘脑-垂体-卵巢轴功能异常
下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）脉冲频率和幅度异常，会影响垂体分泌促卵泡生成素（FSH）和促黄体生成素（LH）。例如，当GnRH脉冲频率过慢时，会导致垂体分泌LH不足，进而影响卵泡的正常发育和黄体的形成。有研究表明，在一些黄体功能不全的患者中，可检测到下丘脑-垂体-卵巢轴的调节失衡，使得卵泡发育到一定阶段后，无法正常触发LH峰，从而影响黄体的生成和功能维持。
垂体疾病也可能导致黄体功能不全，如垂体肿瘤等，会影响垂体激素的正常分泌，进而干扰卵巢的黄体功能。
2.卵巢本身的问题
卵泡发育异常是导致黄体功能不全的一个重要因素。如果卵泡发育不成熟，其分泌的雌激素量不足，会影响子宫内膜的正常转化，进而影响黄体的形成和功能。例如，多囊卵巢综合征患者常存在卵泡发育障碍，多个小卵泡同时发育，但无优势卵泡形成，同时伴有LH分泌异常，使得黄体期孕激素分泌不足，导致黄体功能不全。研究发现，多囊卵巢综合征患者中黄体功能不全的发生率较高，这与患者体内的内分泌紊乱密切相关。
卵巢颗粒细胞病变也会影响黄体功能。颗粒细胞是形成黄体的重要细胞，若颗粒细胞出现病变，如细胞数量减少、功能异常等，会导致孕激素分泌减少。一些遗传性因素或自身免疫性因素可能导致卵巢颗粒细胞发生病变，影响黄体的正常功能。
二、子宫内膜因素
1.子宫内膜受体异常
子宫内膜对孕激素的受体数量和亲和力异常会影响黄体功能。孕激素需要与子宫内膜细胞上的孕激素受体结合才能发挥作用，如果子宫内膜孕激素受体数量减少或亲和力降低，即使有正常量的孕激素分泌，也无法有效地作用于子宫内膜，导致子宫内膜不能正常转化，出现黄体功能不全相关的月经紊乱等表现。研究显示，部分黄体功能不全患者存在子宫内膜孕激素受体表达异常的情况，这可能与遗传因素、自身免疫等多种因素有关。
2.子宫内膜容受性问题
黄体功能不全时，子宫内膜的容受性会受到影响，不利于胚胎着床。正常情况下，黄体分泌的孕激素会使子宫内膜处于分泌期，为胚胎着床做好准备。当黄体功能不全时，子宫内膜分泌期改变不充分，如腺体发育不良等，使得子宫内膜的容受性下降，降低了胚胎着床的成功率，这在有生育需求的黄体功能不全患者中较为重要。
三、其他因素
1.自身免疫因素
自身免疫性疾病可能参与黄体功能不全的发生。例如，抗磷脂抗体综合征患者，体内存在的自身抗体可能影响卵巢的血液循环和黄体细胞的功能，导致黄体分泌孕激素减少。研究表明，抗磷脂抗体综合征患者中黄体功能不全的发生率高于正常人群，自身抗体通过多种机制干扰黄体的正常生理过程，如影响血管内皮细胞功能，导致黄体局部血流供应不足等。
2.生活方式因素
长期的精神压力过大可能影响内分泌系统，进而导致黄体功能不全。精神压力可通过下丘脑-垂体-肾上腺轴影响激素分泌，干扰下丘脑-垂体-卵巢轴的正常调节。例如，长期处于高强度工作压力下的女性，黄体功能不全的风险可能增加。此外，过度减肥、营养不良等也可能影响黄体功能，因为机体需要充足的营养物质来维持正常的内分泌和生殖功能，营养不良会导致激素合成原料不足，影响黄体的正常功能。
3.年龄因素
随着年龄的增长，女性的卵巢功能逐渐衰退，黄体功能也会受到影响。例如，育龄后期的女性，尤其是35岁以上的女性，卵巢储备功能下降，卵泡质量降低，黄体功能不全的发生率相对较高。这是因为随着年龄增加，卵泡发育过程中出现异常的概率增加，同时卵巢内的细胞功能也逐渐衰退，导致黄体生成和功能维持能力下降。
4.遗传因素
某些遗传因素可能与黄体功能不全相关。例如，一些基因的突变可能影响下丘脑-垂体-卵巢轴的相关激素合成、分泌或作用过程。目前已经发现了一些与黄体功能相关的基因位点，若这些位点发生突变，可能导致黄体功能不全的发生。不过，遗传因素在黄体功能不全中的具体作用机制还在进一步研究中，但已有研究提示遗传易感性在黄体功能不全的发病中具有一定作用。
