手足口病主要通过密切接触传播（最主要途径，接触患者分泌物、排泄物等经黏膜或破损皮肤侵入）、飞沫传播（近距离吸入患者咳嗽、打喷嚏产生的含病毒飞沫）、经消化道传播（接触被病毒污染的水源、食物等通过消化道进入人体）三种方式传播。
密切接触传播：这是手足口病最主要的传播途径。直接接触患者的唾液、疱疹液或粪便，例如与患者拥抱、亲吻、共用餐具、水杯、毛巾、玩具等都可能导致感染。因为手足口病患者的这些分泌物和排泄物中含有大量的肠道病毒（主要是肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型等），健康人接触后，病毒可通过口腔、鼻腔、眼睛等黏膜或破损的皮肤侵入人体。对于儿童来说，由于他们的卫生习惯相对较差，且与他人接触频繁，在幼儿园、学校等集体场所更容易发生密切接触传播。比如在幼儿园中，一个孩子感染后，若其玩具被其他孩子接触，就可能导致病毒传播。
飞沫传播：患者在咳嗽、打喷嚏时，会产生含有病毒的飞沫，周围人吸入这些飞沫后可能被感染。一般来说，飞沫传播的距离有限，通常在近距离（1-2米内）传播风险较高。在人群密集且通风不良的场所，如拥挤的教室、密闭的室内等，飞沫传播的几率会增加。例如，当一个手足口病患儿在教室中咳嗽，周围的其他孩子吸入含有病毒的飞沫后，就有可能被感染。
经消化道传播：接触被病毒污染的水源、食物等也可引起感染。被病毒污染的水如果被人饮用，或者食用被病毒污染的未洗净的瓜果、蔬菜等，病毒会通过消化道进入人体。比如，被肠道病毒污染的井水，人们饮用后就可能引发手足口病。在一些卫生条件较差的地区，或者食物在加工、储存过程中受到污染，都可能通过消化道传播导致手足口病的发生。对于年龄较小的儿童，由于他们可能有吸吮手指等行为，如果手指接触到被病毒污染的物品后再放入口中，也容易通过消化道感染病毒。
