肺脓肿有全身症状、呼吸系统症状及其他症状。全身症状为高热、寒战、乏力等，儿童高热突出易惊厥，老年人高热不典型、全身症状重且恢复慢，长期患病者有消瘦贫血等；呼吸系统症状包括咳嗽咳痰（初为黏液或黏液脓性痰，后有脓臭痰且分层，儿童咳痰费力、老年人咳痰差）、胸痛（炎症累及胸膜致痛，不同人群表现不同）、呼吸困难（肺脓肿范围大时出现，儿童易进展为呼吸衰竭、老年人合并基础病时呼吸困难更明显）；其他症状有咯血（量可多可少，因脓肿侵蚀血管）、慢性肺脓肿有杵状指（趾）（长期慢性缺氧致肢体末端血液循环改变）。
一、全身症状
肺脓肿患者常出现高热，多为弛张热，体温可在39~40℃，伴有寒战、乏力、精神萎靡等全身感染中毒症状，这是因为肺部感染后，病原体引发机体的免疫反应，导致全身炎症反应，年龄较小的儿童可能高热表现更突出且易出现惊厥等情况，而老年人可能高热不典型，全身症状相对较重且恢复较慢；长期患病者可能会有消瘦、贫血等慢性消耗表现。
二、呼吸系统症状
1.咳嗽、咳痰
最初可为黏液痰或黏液脓性痰，随着病情进展，脓肿破溃入支气管后，咳出大量脓臭痰，每日可达数百毫升，痰液静置后可分为三层，上层为泡沫，中层为黏液，下层为脓性物及坏死组织。不同年龄段人群表现有差异，儿童咳嗽咳痰相对较费力，可能因不会有效咳痰导致痰液在气道内潴留；老年人咳嗽反射相对减弱，咳痰能力较差。引起咳嗽咳痰的原因是肺部感染灶刺激支气管黏膜，导致分泌物增多，病原体感染引发气道炎症反应。
2.胸痛
炎症累及胸膜时可引起胸痛，疼痛可随呼吸或咳嗽加重，疼痛性质可为刺痛或隐痛等。当肺脓肿靠近胸膜时，炎症刺激胸膜导致胸膜炎症，年龄较大且有基础肺部疾病的患者可能对胸痛的感知和描述相对不典型，而年轻体健者胸痛可能较明显。
3.呼吸困难
当肺脓肿范围较大时，可出现呼吸困难，表现为呼吸急促、气促等。这是由于肺部有效通气面积减少，影响气体交换，儿童因肺组织相对娇嫩，肺脓肿时更易出现呼吸困难，且可能较快进展为呼吸衰竭等严重情况；老年人若合并慢性阻塞性肺疾病等基础病，肺脓肿时呼吸困难会更明显。
三、其他症状
部分患者可出现咯血，量可多可少，少量咯血可为痰中带血，大量咯血可危及生命。咯血的原因是脓肿侵蚀周围血管。另外，慢性肺脓肿患者可能有杵状指（趾），表现为手指或脚趾末端增生、肥厚、呈杵状膨大，这是由于长期慢性缺氧导致肢体末端血液循环改变。
