乳腺原位癌复发受多因素影响，包括肿瘤生物学特性相关因素，如部分原位癌存在原癌基因激活或抑癌基因失活等细胞增殖相关分子异常及细胞周期调控蛋白表达异常；治疗不彻底因素，如手术切除范围不足、辅助治疗不完善；患者个体因素，如年龄、生活方式、病史；肿瘤分子特征因素，如不同分子亚型复发潜在性不同、特定分子异常致生长调控紊乱及分子特征未被考虑影响治疗致复发风险不同。
治疗不彻底因素
手术切除范围不足：乳腺原位癌的手术治疗中，如果手术切除范围不够，未能完全清除所有的病变组织，尤其是一些显微镜下难以察觉的微小病灶，就容易导致复发。例如，在一些早期诊断的乳腺原位癌中，由于对病变边界判断不准确等原因，可能残留少量癌细胞，这些残留细胞在合适条件下会增殖复发。
辅助治疗不完善：部分乳腺原位癌患者可能未接受规范的辅助治疗，如放疗等。对于一些具有高危因素的乳腺原位癌患者，如年轻患者、病变范围较广等情况，放疗可以降低局部复发的风险。如果没有进行充分的放疗，局部复发的可能性会增加。另外，内分泌治疗对于一些激素受体阳性的乳腺原位癌患者是重要的辅助治疗手段，若未规范应用内分泌治疗，也可能导致复发风险升高。
患者个体因素
年龄：年轻患者的乳腺组织生物学活性相对较高，细胞更新代谢较快，即使是原位癌，其潜在的细胞增殖倾向可能更明显，复发风险相对较高。而老年患者身体机能衰退，机体的免疫监视等功能可能有所下降，对癌细胞的清除能力减弱，也可能增加复发几率。
生活方式：不健康的生活方式也可能影响乳腺原位癌的复发。例如长期吸烟、酗酒的患者，烟草中的有害物质和酒精等可能会干扰机体的内分泌系统、免疫系统等，影响身体对癌细胞的监控和清除能力。另外，长期高脂饮食的患者，可能导致体内激素水平失衡等情况，不利于乳腺健康，增加复发风险。
病史：如果患者既往有其他相关疾病史，如本身有免疫系统疾病，会影响机体的免疫功能，使机体对癌细胞的免疫监视功能下降，从而增加乳腺原位癌复发的可能性。还有既往有乳腺其他病变史但未得到妥善处理的情况，也可能对乳腺原位癌的复发产生影响。
肿瘤分子特征因素
乳腺原位癌存在不同的分子特征亚型，某些分子亚型具有更高的复发潜在性。例如，一些与肿瘤侵袭性相关的分子标记物高表达的情况，会使癌细胞更具侵袭和复发倾向。通过基因检测等手段发现的一些特定分子异常，如某些癌基因的过度扩增等，会导致细胞的生长调控机制紊乱，增加了复发的可能性。并且不同分子特征的乳腺原位癌对治疗的反应不同，若分子特征未被充分考虑，治疗方案未能针对性调整，也会影响复发风险。
