百日咳有卡他期、痉咳期、恢复期典型症状，婴儿和新生儿、成人有非典型症状，需与普通感冒、支气管炎鉴别，卡他期类似感冒但咳嗽渐重，痉咳期有阵发性痉挛性咳嗽等特征，恢复期痉咳渐止，婴儿新生儿无鸡鸣样吼声有屏气等，成人症状轻易误诊。
一、典型症状
（一）卡他期
持续时间通常为1-2周，类似普通感冒症状，包括咳嗽逐渐加重、流涕、打喷嚏、轻度发热（体温一般在38℃左右）等，此阶段具有传染性，但症状不特异，易被忽视。年龄较小的儿童可能表现为吃奶困难等情况，这是因为小婴儿咳嗽力量弱，气道分泌物不易排出。
（二）痉咳期
持续时间约为2-4周或更长，主要特征为阵发性、痉挛性咳嗽。咳嗽呈一连串急促的咳嗽，可达十几声甚至数十声，然后伴有深长的吸气，发出鸡鸣样吸气吼声。咳嗽剧烈时可能出现面红耳赤、舌系带溃疡（因剧烈咳嗽舌头与下前牙摩擦所致）、眼结膜充血等表现。成人在痉咳期可能会因为频繁剧烈咳嗽影响日常生活和工作，比如无法正常睡眠、影响正常的社交活动等，而且由于长时间咳嗽，可能会导致胸部肌肉酸痛等情况。
（三）恢复期
痉咳次数逐渐减少至停止，鸡鸣样吸气吼声消失，此阶段一般持续2-3周。但在这一阶段，如果受到呼吸道感染等诱因影响，仍可能再次出现痉咳样症状。
二、非典型症状表现
（一）婴儿和新生儿百日咳
婴儿（通常指1岁以下）和新生儿百日咳往往没有典型的痉咳期鸡鸣样吸气吼声，而是表现为阵发性屏气、发绀、呼吸暂停等。这是因为婴儿的呼吸系统发育尚不完善，剧烈咳嗽时容易出现呼吸功能紊乱。由于呼吸暂停可能导致缺氧，对婴儿的脑等重要器官发育可能产生潜在影响，所以需要特别关注，一旦发现婴儿出现不明原因的阵发性屏气等情况，应高度怀疑百日咳。
（二）成人非典型百日咳
部分成人百日咳症状相对较轻，痉咳不典型，可能仅有轻度咳嗽，持续时间较长，容易被误诊为支气管炎等其他疾病。而且成人感染百日咳后可能作为传染源传播给儿童等易感人群，由于成人自身症状不典型，往往容易忽视隔离等措施，增加了疾病传播的风险。
三、与其他疾病的鉴别要点
（一）与普通感冒鉴别
普通感冒一般咳嗽较轻，不会出现阵发性痉挛性咳嗽及鸡鸣样吸气吼声，病程相对较短，一般1周左右可缓解。而百日咳卡他期虽有类似感冒症状，但咳嗽会逐渐加重并进入痉咳期出现特征性表现。
（二）与支气管炎鉴别
支气管炎主要表现为咳嗽、咳痰，一般无阵发性痉挛性咳嗽及鸡鸣样吸气吼声，肺部可闻及干啰音或不固定的湿啰音，通过详细的病史询问、临床表现及相关检查（如血常规、病原学检查等）可鉴别。百日咳患者血常规中白细胞计数常明显升高，以淋巴细胞为主，而支气管炎一般白细胞计数多正常或轻度升高。
