肺脓肿包括吸入性肺脓肿、血源性肺脓肿、继发性肺脓肿等类型，类型不同病因也不同。
1.吸入性肺脓肿
吸入性肺脓肿是最常见的类型，多由病原体经口、鼻、咽腔吸入致病。当人体在麻醉、醉酒、昏迷、镇静剂过量等情况下，咳嗽反射受到抑制，咽喉部的分泌物或呕吐物容易被吸入气管和肺内，阻塞细支气管，使局部肺组织缺氧，细菌大量繁殖，从而引发肺脓肿。常见的致病菌主要为厌氧菌，如肺炎克雷伯杆菌、金黄色葡萄球菌等，也可能合并需氧菌感染。
2.血源性肺脓肿
血源性肺脓肿主要是由于身体其他部位的感染病灶，如皮肤疖痈、骨髓炎、中耳炎等，引起败血症或脓毒血症，脓毒栓子经血液循环到达肺部，阻塞肺小血管，导致肺组织发生化脓性炎症，进而形成肺脓肿。其致病菌多为金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌等革兰阳性球菌。
3.继发性肺脓肿
继发性肺脓肿多继发于其他肺部疾病。比如，支气管扩张、支气管囊肿、肺结核空洞等疾病，可因分泌物阻塞支气管，继发细菌感染而形成肺脓肿；肺部邻近器官的化脓性病变，如膈下脓肿、肝脓肿、肾周围脓肿等，也可直接蔓延至肺部引起肺脓肿。此外，肺癌阻塞支气管，导致远端肺组织感染坏死，也可能形成肺脓肿。常见的致病菌根据原发病的不同而有所差异，可能包括厌氧菌、需氧菌或混合菌感染。
此外，肺外原因引起的肺部感染，如阿米巴肝脓肿等，可通过血液循环途径，将病原体带入肺部，引发肺脓肿。
