腱鞘囊肿的治疗分为保守治疗和手术治疗。保守治疗包括挤压法（有复发可能，需专业医护操作）、针刺抽吸法（有复发可能，操作需规范）、佩戴支具（限制关节过度活动以减少囊肿形成或复发）；手术治疗适用于保守治疗无效、囊肿大影响关节功能或反复发作时，常见术式是切除囊肿及其相连腱鞘，存在手术创伤和术后恢复问题，不同人群治疗及恢复情况有差异。
一、保守治疗
（一）挤压法
通过外力将腱鞘囊肿挤破，让其内容物自行吸收，但该方法有复发可能，尤其对于多次复发的患者效果欠佳，且操作需由专业医护人员进行，避免损伤周围组织，不同年龄、性别、生活方式及病史的患者均可尝试，但需注意操作风险。
（二）针刺抽吸法
用注射器将腱鞘囊肿内的液体抽出，之后可注入少量糖皮质激素等药物，不过也存在复发情况，对于不同人群操作时需严格遵循无菌等操作规范，以降低感染等风险，年龄较小儿童因配合度等问题需谨慎评估后操作。
（三）佩戴支具
对于因过度使用关节导致的腱鞘囊肿，可通过佩戴相应关节的支具来限制关节过度活动，从而减少囊肿的形成或复发，不同年龄患者需根据关节情况选择合适尺寸的支具，生活方式中经常进行重体力劳动或关节过度活动的人群更需注意佩戴支具。
二、手术治疗
（一）适应情况
当保守治疗无效、囊肿较大影响关节功能或反复发作时可考虑手术治疗，不同年龄患者手术风险有所不同，一般来说儿童手术需考虑麻醉等风险，性别差异在此手术选择上无明显特殊影响，有基础病史的患者需评估基础病对手术的影响。
（二）手术方式
常见的手术方式是将腱鞘囊肿及其相连的腱鞘一并切除，手术能较为彻底地去除囊肿，但也存在一定的手术创伤及术后恢复问题，术后需注意伤口护理等，不同人群术后恢复因身体状况等因素会有差异。
