女性尿道感染由多种因素导致，包括解剖结构上尿道短宽直且距肛门近、性生活时易带入细菌及多性伴侣增加风险、泌尿系统结构异常致尿液引流不畅、机体免疫力下降时抵御能力弱、局部卫生不佳使细菌滋生易侵入尿道等。
解剖结构因素：女性尿道短、宽且直，距离肛门较近，这使得细菌更容易从肛门周围通过尿道逆行进入尿道甚至膀胱引发感染。例如，成年女性尿道长度约3-5厘米，相比男性尿道短很多，细菌更易侵入。在青春期前女孩，尿道较短且未完全发育成熟，同样存在感染风险；而绝经后女性，由于雌激素水平下降，尿道黏膜变薄，局部抵抗力降低，也易发生尿道感染。
性生活因素：性生活时容易将外部细菌带入尿道，尤其是不注意性生活卫生时。比如，性生活前后不清洗外生殖器，会增加细菌进入尿道的机会。另外，多个性伴侣也会增加尿道感染的发生概率，因为不同性伴侣可能携带不同种类的细菌，增加了感染病原体的多样性。
泌尿系统结构异常因素：如存在尿道结石、膀胱结石等泌尿系统结石性疾病，会导致尿液引流不畅，细菌容易在局部滋生繁殖从而引发感染。还有先天性泌尿系统畸形，如肾盂输尿管连接部狭窄等，也会影响尿液的正常排出，为细菌感染创造条件。一些女性可能有既往泌尿系统手术史，术后尿道或泌尿系统局部的解剖结构发生改变，也容易导致尿道感染。
机体免疫力因素：当女性机体免疫力下降时，如患有糖尿病等慢性疾病，或者长期使用免疫抑制剂等情况，身体对细菌的抵御能力减弱，更容易发生尿道感染。例如，糖尿病患者由于血糖水平高，尿液中葡萄糖含量增加，有利于细菌生长繁殖；长期使用免疫抑制剂的患者，自身免疫系统功能受到抑制，无法有效清除入侵的细菌。
局部卫生因素：不注意外阴部清洁，如不经常更换内裤、不清洗外阴等，会使外阴部细菌滋生，进而容易侵入尿道引起感染。尤其是在月经期间，经血是细菌良好的培养基，如果不及时更换卫生巾，会大大增加尿道感染的风险。
