脸上长扁平疣主要由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，与HPV-3型、HPV-5型等密切相关，自身因素方面包括皮肤屏障功能较弱、免疫力低下，外部感染因素有直接接触传染和间接接触传染。
一、自身因素
1.皮肤屏障功能较弱
皮肤是人体抵御外界病原体的第一道防线。如果皮肤的屏障功能较弱，例如皮肤处于干燥状态、皮肤的角质层薄等情况，就更容易让HPV侵入。青少年由于皮肤的角质层相对较薄，皮肤屏障功能尚未完全发育成熟，相对成年人更易感染HPV引发扁平疣。对于儿童来说，皮肤娇嫩，在玩耍过程中如果皮肤有微小破损，就增加了HPV感染的风险。
长期处于不良生活方式的人群，如作息不规律、过度疲劳等，会影响身体的免疫力，进而影响皮肤的免疫监视功能，使身体清除HPV的能力下降，增加长扁平疣的几率。比如一些熬夜学习的青少年，长期睡眠不足导致免疫力降低，容易长扁平疣。
2.免疫力低下
当人体免疫力低下时，对HPV的抵抗力减弱。例如患有某些慢性疾病（如糖尿病等）的人群，身体的免疫功能受到影响，更容易感染HPV并患上扁平疣。艾滋病患者由于免疫系统严重受损，感染HPV后发生扁平疣等病变的风险极高。对于儿童来说，如果本身存在先天性免疫缺陷疾病，那么感染HPV长扁平疣的可能性也会大大增加。
二、外部感染因素
1.直接接触传染
与扁平疣患者直接接触是常见的感染途径。比如和扁平疣患者握手、共用毛巾、脸盆等个人物品时，HPV可以通过皮肤的接触传播。在学校、家庭等集体生活环境中，如果有同学患有扁平疣，就容易在人群中相互传染。儿童在幼儿园等集体场所，由于密切接触的机会较多，一旦有感染源存在，就较易被传染上扁平疣。
2.间接接触传染
通过接触被HPV污染的物品也可能感染。例如在公共浴室、游泳池等场所，接触了被HPV污染的水或者物品表面，也有可能感染HPV引发扁平疣。对于儿童来说，在公共泳池玩耍时，如果泳池的卫生状况不佳，就有感染HPV的风险。
