非淋菌性尿道炎的发生与病原体感染及其他因素有关，病原体方面沙眼衣原体、解脲支原体、人型支原体可引发感染，其他因素包括不安全性行为、局部免疫因素、尿道损伤、基础疾病影响等。
一、病原体感染
1.沙眼衣原体：是非淋菌性尿道炎的主要病原体之一，约50%-60%的非淋菌性尿道炎由沙眼衣原体引起。沙眼衣原体主要侵犯柱状上皮和移行上皮，通过其表面的特殊结构吸附并侵入宿主细胞，在细胞内生长繁殖，导致细胞损伤和炎症反应。性行为是其主要传播途径，尤其在性活跃的青、中年人群中，由于性接触频繁，感染风险较高。
2.解脲支原体：约20%-30%的非淋菌性尿道炎由解脲支原体所致。解脲支原体可黏附于尿道上皮细胞表面，利用自身的结构和代谢方式获取营养并生存，引起尿道黏膜的炎症，其传播方式同样主要为性接触传播，在有多个性伴侣或不注意性卫生的人群中更易感染。
3.人型支原体：也可引起非淋菌性尿道炎，但其引起感染的比例相对沙眼衣原体和解脲支原体较低。人型支原体感染后可引发尿道的炎症反应，同样通过性接触传播，与患者的性行为方式等生活方式因素密切相关。
二、其他因素
1.性行为因素：不安全性行为是导致非淋菌性尿道炎的重要原因。例如，有多个性伴侣、初次性交年龄小等情况会显著增加感染风险。因为频繁的性接触会使病原体传播的机会大大增加，尤其是在没有采取安全防护措施（如使用安全套）的情况下，病原体更容易在性伴侣之间传播。
2.局部免疫因素：尿道局部的免疫功能状况与非淋菌性尿道炎的发生有关。如果尿道局部的黏膜屏障功能减弱，或者局部的免疫细胞功能异常，就更容易受到病原体的侵袭而引发炎症。例如，长期处于疲劳、压力大等状态下的人群，机体免疫力下降，相对更容易感染非淋菌性尿道炎。
3.尿道损伤：尿道器械检查、导尿等操作可能导致尿道黏膜损伤，使尿道黏膜的完整性被破坏，从而为病原体的入侵创造了条件，增加了非淋菌性尿道炎的发病几率。例如，进行尿道镜检查后，如果没有做好局部的护理，就可能引发尿道的感染炎症。
4.基础疾病影响：某些基础疾病也可能影响非淋菌性尿道炎的发生。比如患有糖尿病的患者，由于血糖控制不佳，机体的抵抗力下降，同时高血糖的环境有利于病原体的生长繁殖，所以糖尿病患者发生非淋菌性尿道炎的风险相对较高。而且糖尿病患者在治疗过程中如果血糖波动较大，会进一步影响病情的恢复和对感染的抵御能力。
