甲肝疫苗分为免费的减毒活疫苗和自费的灭活疫苗，减毒活疫苗通过减毒处理让病毒保持免疫原性，接种程序简单，适用于大部分健康人群但特殊人群需谨慎，免疫效果较好且持久；灭活疫苗通过灭活病毒保留抗原性，接种程序多样，适用人群更广，免疫效果也佳且相对安全，免费疫苗价格低可及性高，自费疫苗价格高可及性相对窄。
一、疫苗成分与工艺方面
1.免费甲肝疫苗：通常为减毒活疫苗，是将甲肝病毒经过减毒处理后制成。其原理是让病毒在保持一定免疫原性的同时降低致病性，通过接种后在人体内引起轻度感染，从而激发机体的免疫反应。例如我国免费的甲肝减毒活疫苗，是将甲肝病毒在特定培养基中培养后，经过减毒等工艺步骤制备而成，一般采用皮下注射的方式接种。从科学研究角度，减毒活疫苗具有免疫效果较为持久的特点，相关研究显示其接种后机体产生的抗体持续时间较长，能在较长时间内提供对甲肝病毒的保护。
2.自费甲肝疫苗：多为灭活疫苗，是通过物理或化学方法将甲肝病毒杀死，使其失去感染性和致病性，但保留病毒的抗原性，接种后能刺激机体产生免疫应答。比如市场上常见的自费甲肝灭活疫苗，是将甲肝病毒培养后，经过灭活、纯化等工艺步骤制成，同样通过注射途径接种。研究表明，灭活疫苗相对更安全，对于一些免疫功能不太稳定或者有特殊健康状况的人群可能更适用，因为它不会像减毒活疫苗那样存在理论上的病毒返祖等潜在风险。
二、接种程序方面
1.免费甲肝疫苗：一般接种程序相对简单，例如我国部分免费甲肝减毒活疫苗通常是接种1剂次。但也有不同地区可能根据实际情况有细微调整，不过总体剂次较少。从免疫应答角度看，接种1剂次后，大部分人群能产生足够的抗体来抵御甲肝病毒感染，但对于一些免疫力较弱的个体，可能抗体产生的程度和持久性会有差异。
2.自费甲肝疫苗：接种程序相对灵活多样，常见的有2剂次接种程序，即第0天和第6-12个月各接种1剂次。这种程序设计是基于灭活疫苗的免疫特性，通过两次接种来增强免疫应答，使机体产生更持久、更强烈的抗体反应。对于注重免疫效果持久性，或者有出国等需要提前获得更牢固免疫保护的人群来说，自费灭活疫苗的2剂次程序可能更合适。
三、适用人群方面
1.免费甲肝疫苗：一般适用于常规免疫程序下的大部分健康儿童等人群。对于年龄较小的儿童，在符合国家免疫规划的情况下接种免费甲肝减毒活疫苗。但对于一些有免疫缺陷、正在接受免疫抑制治疗等特殊健康状况的儿童，可能需要谨慎评估，因为减毒活疫苗存在一定的潜在风险，虽然概率较低，但对于这类特殊人群需要考虑疫苗接种后的不良反应发生风险以及免疫效果可能受到的影响。例如患有先天性免疫缺陷病的儿童，接种减毒活疫苗后可能无法正常激发免疫反应，或者出现较严重的疫苗相关反应。
2.自费甲肝疫苗：适用人群更为广泛。对于免费疫苗接种后免疫应答不佳的人群，或者是特殊职业人群（如食品行业从业者等）、有出国计划需要较高免疫保护水平的人群等，自费灭活疫苗是一个补充选择。因为灭活疫苗相对更安全，对于免疫功能存在一定问题的人群，如患有慢性疾病且免疫功能有所下降的成年人，接种自费灭活疫苗可能是更稳妥的方式，能在一定程度上降低疫苗相关风险，同时也能刺激机体产生免疫应答。例如患有糖尿病且血糖控制不稳定的成年人，接种自费甲肝灭活疫苗时，由于其灭活的特性，相对减毒活疫苗来说，引发严重不良反应的可能性更低。
四、免疫效果方面
1.免费甲肝疫苗：减毒活疫苗的免疫效果在一般人群中通常能达到较好水平，接种后抗体阳转率较高。有研究数据显示，接种免费甲肝减毒活疫苗后，抗体阳转率可达到90%以上，并且抗体持续时间较长，部分研究表明可维持10年甚至更久。但对于不同个体来说，由于个体差异，如年龄、健康状况等因素，免疫效果会有一定波动。比如婴幼儿相对于成年人，免疫系统发育尚未完善，接种减毒活疫苗后的免疫效果可能在抗体水平和持久性上稍逊于成年人，但总体仍能提供有效的保护。
2.自费甲肝疫苗：灭活疫苗的免疫效果也经过大量研究验证。接种2剂次自费甲肝灭活疫苗后，抗体阳转率同样较高，且抗体水平可能在某些方面表现更优。有研究表明，接种2剂次自费甲肝灭活疫苗后，抗体滴度更高，并且在免疫记忆方面可能有更好的表现，能在再次接触甲肝病毒时更快激发免疫反应。对于一些需要快速获得较高免疫保护的人群，如即将前往甲肝流行地区的人群，自费灭活疫苗的2剂次接种程序能更快让机体产生足够的抗体来抵御甲肝病毒感染。
五、价格与可及性方面
1.免费甲肝疫苗：价格较低甚至免费，可及性高，主要通过国家免疫规划渠道进行接种，在各地的社区卫生服务中心、疾控中心等机构都能方便地接种到免费甲肝疫苗，对于符合国家免疫规划接种条件的人群来说，能以很低的成本获得甲肝疫苗的接种服务。
2.自费甲肝疫苗：价格相对较高，可及性相对免费疫苗来说，除了在常规预防接种机构外，在一些私立医疗机构等也可接种，但可能需要支付相应的费用。对于一些注重疫苗接种的安全性、免疫效果持久性等，且有经济能力承担自费疫苗费用的人群来说，可以选择自费甲肝疫苗。
