眼结石的引起原因主要有慢性炎症刺激、眼部长期受刺激、年龄因素影响，长期患眼部慢性炎症等会致睑结膜反复炎症形成眼结石，长期戴不合适隐形眼镜等致眼部受刺激易促其形成，随年龄增长老年人因睑结膜上皮细胞更新代谢慢易增加几率，儿童也可能因相关情况出现但几率较低。
慢性炎症刺激：长期患有眼部慢性炎症，如沙眼、慢性结膜炎等，会使睑结膜处于反复的炎症状态。在炎症过程中，睑板腺分泌功能异常，睑结膜的上皮细胞会发生代谢紊乱，导致上皮细胞堆积以及黏液浓缩，逐渐形成眼结石。例如，沙眼患者由于沙眼衣原体感染，眼部长期受到炎症刺激，更容易出现眼结石。不同年龄段的人群都可能因慢性炎症刺激引发眼结石，儿童如果眼部卫生不佳，感染病菌导致慢性结膜炎，也有患眼结石的可能；成年人长期处于污染环境或有不良用眼习惯，也易因慢性炎症刺激长眼结石。
眼部长期受刺激：长期佩戴不合适的隐形眼镜、长期处于粉尘较多的环境中工作或生活等，会使眼部不断受到刺激。隐形眼镜佩戴不合适会影响眼部的正常代谢和泪液循环，粉尘等异物进入眼部后会对睑结膜产生持续刺激，进而促使眼结石的形成。对于长期佩戴隐形眼镜的人群，不同性别都需要注意正确佩戴和护理隐形眼镜，若出现眼部不适要及时处理；在粉尘环境工作的人群，无论男女都应做好眼部防护，如佩戴防护眼镜等，以减少眼部受刺激的机会，降低眼结石的发生风险。
年龄因素影响：随着年龄增长，眼部组织会发生一定的退行性变化。老年人的睑结膜上皮细胞更新代谢相对缓慢，更容易出现上皮细胞堆积和黏液浓缩的情况，从而增加眼结石的发生几率。老年人群体要更加注重眼部的日常保健，定期进行眼部检查，一旦发现眼部异常及时就医。而儿童相对发生眼结石的几率较低，但如果有上述慢性炎症或眼部受刺激等情况，也可能出现。儿童眼部较为娇嫩，家长要特别注意儿童的眼部卫生，避免儿童用手揉眼等不良习惯，预防眼部炎症和眼结石的发生。
