亚急性甲状腺炎有全身症状和甲状腺局部症状，全身症状包括多数患者有不同程度发热（体温38℃左右或更高，持续数天至数周，儿童发热明显且变化快，老年人发热可加重基础病）及乏力、肌肉酸痛等全身不适；甲状腺局部症状有甲状腺不同程度肿大（单侧或双侧，质地硬、有压痛，疼痛可放射，儿童肿大不易察觉，妊娠期肿大可能影响胎儿，有甲状腺疾病史者再次发病疼痛表现不同）、甲状腺区域明显疼痛与触痛（吞咽时加重，疼痛性质多样，老年患者痛觉不敏感但仍需依体征判断）。
发热：多数患者会出现不同程度的发热，体温一般在38℃左右，也有部分患者体温可高达39℃以上，发热可持续数天至数周不等。这是因为炎症反应刺激机体产生一系列免疫应答，导致体温调节中枢功能紊乱。在儿童群体中，由于其免疫系统发育尚未完善，发热可能相对更为明显且变化较快，需密切关注体温变化及相关伴随症状。对于有基础疾病的老年人，发热可能会加重其基础疾病的病情，如诱发心脑血管意外等，所以需要更谨慎地监测和处理。
全身不适：患者常感到乏力、肌肉酸痛等全身不适症状。乏力可能是由于炎症消耗机体能量以及身体处于应激状态所致，肌肉酸痛则与炎症导致的局部代谢产物堆积、炎性介质释放等有关。在生活方式方面，长期劳累、缺乏运动的人群患亚急性甲状腺炎时，全身不适的症状可能会更明显，而规律生活、适当运动的人群相对症状可能较轻。
甲状腺局部症状
甲状腺肿大：甲状腺部位会出现不同程度的肿大，可单侧肿大，也可双侧肿大，肿大的甲状腺质地较硬，有压痛，疼痛可放射至耳部、下颌等部位。疼痛程度因人而异，部分患者疼痛较为剧烈，影响日常生活和睡眠。在儿童亚急性甲状腺炎患者中，甲状腺肿大可能相对不太容易被家长察觉，需要通过仔细的体格检查才能发现。对于妊娠期女性，甲状腺肿大可能会对胎儿产生一定影响，需要在产科和内分泌科的共同监测下进行处理。
甲状腺疼痛与触痛：甲状腺区域有明显的疼痛和触痛，吞咽时疼痛可加重。疼痛性质多样，可为胀痛、刺痛等。这种疼痛是由于炎症累及甲状腺组织，刺激周围神经末梢引起的。在老年患者中，由于痛觉神经敏感性下降，疼痛可能不如中青年患者明显，但仍需通过其他体征来判断病情。有甲状腺疾病病史的患者，再次发生亚急性甲状腺炎时，疼痛的表现可能与首次发病有所不同，需要综合考虑既往病史进行诊断。
