内斜视的发生有先天性和后天性因素。先天性因素包括眼外肌发育异常（与遗传可能相关）、染色体异常（如唐氏综合征患儿常伴内斜视）；后天性因素有屈光不正（高度远视易致内斜视）、神经支配因素（动眼神经麻痹等可致）、眼部疾病（外伤、肿瘤可影响眼球运动）、全身疾病（神经系统疾病、内分泌疾病如甲状腺相关眼病可引发）。
一、先天性因素
（一）解剖结构异常
1.眼外肌发育异常：胎儿在发育过程中，眼外肌的发育出现异常情况，比如某条眼外肌的肌纤维数量、走行等方面存在畸形，就可能导致内斜视。从胚胎发育学角度来看，眼外肌的正常发育对眼球的运动协调至关重要，异常发育会打破这种协调，进而引发内斜视。这种情况在出生时往往就已经存在，与遗传因素可能有一定关联，若家族中有先天性内斜视的病史，后代发生先天性内斜视的风险可能会增加。
2.染色体异常：某些染色体数目或结构的异常可能会影响眼部的正常发育，从而导致内斜视的发生。例如21-三体综合征（唐氏综合征）患儿，除了有特殊面容、智力低下等表现外，常常伴有眼部的多种异常，内斜视就是其中较为常见的眼部问题之一。这是因为染色体上携带的基因与眼部发育的调控密切相关，染色体异常会干扰这些基因的正常功能，使得眼部结构和功能发育出现障碍。
二、后天性因素
（一）屈光不正
1.远视眼：当患者存在远视时，眼睛为了看清近处物体，会过度使用调节功能。长时间的过度调节会引起双眼内聚，久而久之就可能导致内斜视。一般来说，高度远视更容易引发这种情况。例如，一个患有高度远视的儿童，如果没有及时进行屈光矫正，随着年龄增长，发生内斜视的概率会明显增加。这是因为远视眼的眼球轴长相对较短，光线聚焦在视网膜后方，为了使焦点前移到视网膜上，需要动用更多的调节力，而过度调节会伴随双眼内转的协同动作，长期如此就会导致内直肌过于紧张，外直肌相对薄弱，从而引发内斜视。
2.其他屈光不正：除了远视眼外，近视等屈光不正也可能在一定情况下导致内斜视，但相对远视眼来说，其引发内斜视的机制和概率有所不同。不过，当屈光不正没有得到良好矫正时，都会影响双眼的视觉平衡，进而可能促使内斜视的发生。
（二）神经支配因素
1.支配眼外肌的神经麻痹：例如动眼神经麻痹，会导致其所支配的眼外肌运动功能障碍。如果是内直肌所对应的神经分支麻痹，就会使内直肌无法正常收缩，而外直肌相对正常收缩，从而引起内斜视。这种情况可能由多种原因引起，如颅内病变（像动脉瘤、肿瘤等压迫动眼神经）、外伤等。例如头部受到外伤后，可能会损伤动眼神经，导致眼外肌麻痹，进而出现内斜视。
2.辐辏与调节反射异常：正常情况下，眼睛看近处物体时会发生调节和辐辏反射，两者是协同的。但如果这种反射出现异常，比如调节过度而辐辏不足，或者调节与辐辏不匹配，就可能打破眼位的平衡，导致内斜视。例如某些神经系统疾病可能影响到这种反射的神经调节机制，使得调节和辐辏反射不能正常协同工作，从而引发内斜视。
（三）眼部疾病
1.眼部外伤：眼部受到外伤时，可能会直接损伤眼外肌、眼球壁等结构，从而影响眼球的正常运动，导致内斜视。比如眼部受到撞击后，眼外肌的附着点可能发生移位，或者眼外肌本身受到损伤，使得眼球的运动不协调，出现内斜视。这种外伤性内斜视的发生与外伤的严重程度、受伤的部位等密切相关。
2.眼部肿瘤：眼眶内的肿瘤如果压迫到眼外肌或支配眼外肌的神经，就会影响眼球的运动，进而引发内斜视。例如眼眶内的横纹肌肉瘤等肿瘤，随着肿瘤的生长，会对周围的眼外肌和神经造成压迫，导致眼球运动异常，出现内斜视。不同类型的眼部肿瘤对眼位的影响机制可能有所不同，但都会干扰眼球的正常运动平衡。
（四）全身疾病
1.神经系统疾病：某些神经系统疾病，如脑部肿瘤、脑血管意外等，可能会影响到控制眼外肌运动的神经中枢或神经传导通路，从而导致内斜视。例如脑部的垂体瘤，如果压迫到周围的神经结构，可能会影响到眼球运动相关神经的功能，进而引发内斜视。神经系统疾病导致的内斜视往往还会伴随其他神经系统症状，如头痛、呕吐、肢体运动障碍等。
2.内分泌疾病：例如甲状腺相关眼病，患者体内甲状腺激素水平异常，会引起眼眶内的组织发生免疫炎症反应，导致眼外肌增厚、纤维化等改变，从而影响眼球的运动，出现内斜视。甲状腺相关眼病患者除了内斜视外，还可能伴有眼球突出、眼睑肿胀等表现。内分泌疾病引起内斜视的机制与内分泌激素对眼部组织的代谢、免疫等方面的影响有关。
