真菌性肺炎与念珠菌属等致病真菌相关，念珠菌在宿主免疫受损时增殖感染，曲霉菌经吸入孢子在免疫低下时定植，隐球菌经呼吸道传播在免疫缺陷者高发；宿主方面婴幼儿和老年人因免疫因素易发病，糖尿病、艾滋病、恶性肿瘤、慢阻肺等基础疾病患者因自身或治疗因素免疫低下易患，长期用广谱抗生素、激素、免疫抑制剂及有创操作等会增加真菌性肺炎发生率。
一、病原体因素
真菌性肺炎的发生与多种致病真菌密切相关，常见的有：
1.念珠菌属：属于条件致病性真菌，当宿主免疫功能受损（如长期使用广谱抗生素导致菌群失调、接受免疫抑制治疗等）时，念珠菌可大量增殖并侵袭肺部引发感染。
2.曲霉菌属：主要通过吸入空气中的孢子感染肺部，在机体免疫功能低下（如恶性肿瘤放化疗后、器官移植后长期使用免疫抑制剂）时，曲霉菌易定植于肺部并引起炎症反应。
3.隐球菌属：主要经呼吸道吸入传播，免疫功能缺陷者（如艾滋病患者）是隐球菌性肺炎的高危人群，隐球菌可在肺部定植并进一步播散至全身。
二、宿主因素
1.年龄因素
婴幼儿免疫系统发育尚不完善，对真菌的抵御能力较弱，易因感染致病；老年人随着年龄增长免疫功能衰退，呼吸道局部防御机制减弱，更容易发生真菌性肺炎。
2.基础疾病因素
患有糖尿病的患者，高血糖环境有利于真菌生长繁殖；艾滋病患者由于CD4T淋巴细胞显著减少，免疫功能严重受损，是多种真菌性肺炎的高发人群；此外，患有恶性肿瘤、慢性阻塞性肺疾病等基础疾病的患者，因疾病本身或接受放化疗、糖皮质激素治疗等导致免疫功能低下，易发生真菌性肺炎。
3.治疗相关因素
长期使用广谱抗生素会破坏呼吸道正常菌群平衡，增加真菌定植风险；长期应用糖皮质激素、免疫抑制剂等药物会抑制机体免疫功能，使宿主对真菌的抵抗力下降，从而易引发真菌性肺炎；另外，长期住院接受有创机械通气、中心静脉置管等侵入性操作的患者，接触真菌的机会增多，真菌性肺炎发生率升高。
