精索脂肪瘤形成受脂肪代谢异常因素影响，如代谢基因微小变异、性别激素差异、不同年龄段代谢活力与调节能力及代谢综合征致胰岛素抵抗干扰脂肪代谢使脂肪局部沉积，还受局部组织异常增生因素影响，像长期高热量高脂肪饮食、缺乏运动影响局部组织微环境与代谢增殖，内分泌系统疾病（如甲状腺功能减退症、下丘脑-垂体疾病）干扰代谢与细胞增殖调控致组织异常增殖分化。
一、脂肪代谢异常因素
脂肪代谢过程受多种体内因素调控，若个体存在代谢基因的微小变异等情况，可能导致脂肪代谢失衡。在性别方面，不同性别因激素水平等差异，对脂肪代谢的影响不同，比如男性和女性的激素环境对脂肪的分布及代谢速率有差异，可能使部分人群更易出现脂肪在精索部位异常积聚。年龄也是重要因素，青少年至中老年不同年龄段，机体的代谢活力和调节能力不同，年轻人群代谢相对旺盛但若有不良生活方式等影响，中老年人群代谢机能减退，都可能影响脂肪代谢平衡，增加精索脂肪瘤形成中脂肪代谢异常的风险。例如，有研究表明，代谢综合征患者常伴随脂肪代谢紊乱，这类人群精索脂肪瘤的发生概率可能相对较高，其原因在于代谢综合征相关的胰岛素抵抗等问题干扰了正常的脂肪代谢途径，使得脂肪组织在精索局部异常沉积。
二、局部组织异常增生因素
精索部位的组织细胞受到多种潜在刺激时可能发生异常增殖分化。生活方式因素中，长期高热量、高脂肪饮食会使体内脂肪总量增多，同时可能影响局部组织微环境，刺激组织细胞异常增殖；缺乏运动则会导致机体代谢减缓，脂肪消耗减少，也可能间接影响精索局部组织的代谢和细胞增殖状态。病史方面，若个体有内分泌系统疾病，如甲状腺功能减退症，甲状腺激素分泌不足会影响机体的新陈代谢速率，包括脂肪的分解代谢等，进而可能导致脂肪在精索部位异常聚集形成脂肪瘤；又如下丘脑-垂体疾病影响了激素的正常分泌和调节，也可能干扰精索局部组织的正常代谢与细胞增殖调控，增加精索脂肪瘤形成的可能性。
