特发性血小板减少紫癜需与自身免疫性疾病鉴别，自身免疫性疾病多系统受累且自身抗体多阳性而特发者自身抗体常阴性或少量非特异性；与感染相关性血小板减少鉴别，感染相关性有明确感染史且感染控制后血小板可回升，特发者无明确近期感染诱发证据；与血液系统恶性疾病鉴别靠骨髓穿刺，恶性疾病有异常细胞克隆而特发者巨核细胞数量正常或增多伴成熟障碍；儿童特发者需与病毒感染后血小板减少鉴别并排除其他血液疾病；妊娠期特发者需与特有并发症鉴别并综合考虑妊娠生理影响。
一、与自身免疫性疾病鉴别
自身免疫性疾病如系统性红斑狼疮等可伴发血小板减少。系统性红斑狼疮常具有多系统受累表现，除血小板减少外，还可能出现皮疹（如面部蝶形红斑）、关节痛、蛋白尿等症状，通过自身抗体检测可辅助鉴别，系统性红斑狼疮患者自身抗体如抗核抗体、抗双链DNA抗体等多呈阳性，而特发血小板减少紫癜自身抗体通常为阴性或仅有少量非特异性自身抗体。
二、与感染相关性血小板减少鉴别
病毒感染等可引起血小板减少，此类情况一般有明确感染病史，如近期有病毒感染（如EB病毒、巨细胞病毒等感染）表现。感染相关性血小板减少通常在感染急性期出现血小板降低，随着感染得到控制，血小板计数多可逐渐回升至正常范围，而特发血小板减少紫癜一般无明确近期感染诱发的直接证据，且血小板减少并非由感染直接清除血小板所致。
三、与血液系统恶性疾病鉴别
血液系统恶性疾病如白血病、淋巴瘤等可导致血小板减少，通过骨髓穿刺等检查可进行鉴别。血液系统恶性疾病患者骨髓穿刺可见原始细胞增多或存在异常淋巴细胞浸润等异常细胞克隆情况，而特发血小板减少紫癜患者骨髓象主要表现为巨核细胞数量正常或增多，伴有成熟障碍等，无恶性细胞克隆证据。
特殊人群注意事项
儿童群体：儿童特发血小板减少紫癜需与病毒感染后血小板减少鉴别，儿童病毒感染后血小板减少多有明确病毒感染史，病程呈自限性，一般感染控制后血小板可逐渐恢复，而儿童特发血小板减少紫癜需进一步通过骨髓等检查排除其他血液系统疾病；
妊娠期女性：妊娠期特发血小板减少紫癜需注意与妊娠期特有并发症鉴别，妊娠期免疫状态改变可能影响鉴别，需谨慎评估，避免过度医疗，同时需关注妊娠期母体及胎儿健康，在鉴别过程中需综合考虑妊娠生理变化对血小板计数等指标的影响。
