基孔肯雅热的误诊率相对较高，常被误诊为多种疾病。
其典型症状如发热、关节疼痛等，与登革热极为相似，在缺乏特异性检测手段时，很容易将基孔肯雅热误判为登革热。此外，关节疼痛症状突出且严重时，又可能被误诊为类风湿关节炎等风湿免疫性疾病。一些患者伴有皮疹，还可能被当作普通的病毒性皮疹疾病处理。
为降低误诊率，对于在流行地区有蚊虫叮咬史，出现不明原因发热、关节疼痛等症状的患者，医生应提高警惕，详细询问病史，进行全面的体格检查，并结合血清学检测、病毒核酸检测等特异性检查方法，以准确诊断基孔肯雅热，避免延误治疗。
本内容不能作为治疗依据，如有不适请到医院进行科学治疗
