基孔肯雅热病毒主要通过蚊虫叮咬传播，人类是终末宿主而非主要传播源。
基孔肯雅病毒的核心传播途径是蚊媒传播，埃及伊蚊和白纹伊蚊是主要传播媒介。当蚊虫叮咬感染病毒的人类或动物（如灵长类）后，病毒会在其体内复制，随后通过再次叮咬将病毒注入健康人体血液中，完成“感染者-蚊虫-健康人”的传播链。热带、亚热带地区因蚊虫密度高、活动频繁，病毒传播效率显著提升。
病毒需在蚊虫体内完成5-10天的复制周期才能具备传染性，且蚊虫需多次吸食不同感染者的血液以维持传播能力。人类感染后虽会短暂带毒，但病毒血症期较短（通常不超过一周），且无法通过空气、接触或性行为直接传播给他人（母婴垂直传播极为罕见），因此防控重点在于切断蚊媒传播路径。
清除积水、使用驱蚊剂、安装纱窗蚊帐等措施可有效降低感染风险，疫区旅行者需特别注意避免蚊虫叮咬。
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