拉肚子时肚子疼的原因主要有：肠道蠕动异常会因过度加快蠕动使肠道肌肉强烈收缩引发肚子疼，婴儿和老年人较易受影响；炎症刺激因病原体侵袭或饮食不当等致炎症因子释放刺激肠道神经末梢引发肚子疼，长期饮食不规律等人群、女性生理期及有肠道基础病史者易受影响；肠道痉挛因肠道内环境改变如电解质失衡诱发，长期大量饮酒者、儿童较易出现。
一、肠道蠕动异常引发肚子疼
拉肚子时，肠道通常会出现异常蠕动。正常情况下，肠道的蠕动是有节律且协调的，以推动食物残渣有序通过。但当发生拉肚子时，肠道为了尽快将刺激物或病原体排出体外，会加快蠕动速度。这种过度加快的蠕动会使肠道肌肉强烈收缩，从而引发肚子疼。例如，一些感染性腹泻的患者，病原体刺激肠道黏膜，导致肠道蠕动紊乱，频繁的肠道收缩就会带来腹痛感。对于不同年龄段的人群，婴儿肠道功能发育尚不完善，更容易因肠道蠕动异常出现拉肚子伴腹痛；老年人肠道功能衰退，也较易受肠道蠕动变化影响而产生腹痛。
二、炎症刺激导致肚子疼
拉肚子往往伴随肠道炎症反应。当肠道受到细菌、病毒等病原体侵袭，或者因饮食不当等原因出现炎症时，炎症因子会释放，刺激肠道神经末梢。比如细菌性痢疾，痢疾杆菌感染肠道后，会引起肠道黏膜的炎症、渗出等病变，炎症刺激使得肠道神经敏感，进而引发腹痛。在生活方式方面，长期饮食不规律、经常食用刺激性食物的人群，肠道本身处于相对敏感状态，更容易在拉肚子时因炎症刺激出现较明显的腹痛。对于女性而言，生理期身体抵抗力可能会有一定变化，若此时发生拉肚子，炎症刺激导致腹痛的情况可能相对更易发生；而有肠道基础病史的人群，如溃疡性结肠炎患者，本身肠道就存在慢性炎症，拉肚子时炎症刺激会使腹痛症状加重且更难缓解。
三、肠道痉挛造成肚子疼
拉肚子时肠道痉挛也是导致肚子疼的常见原因。肠道痉挛是肠道肌肉突发性的强烈收缩。当肠道内环境因拉肚子发生改变，如电解质失衡等，会诱发肠道痉挛。例如，拉肚子导致大量水分和电解质丢失，引起电解质紊乱，进而刺激肠道平滑肌发生痉挛，表现为阵发性的肚子疼。不同生活方式的人群受影响程度不同，长期大量饮酒的人群，肠道受到酒精刺激，肠道环境易紊乱，更易在拉肚子时出现肠道痉挛性腹痛；儿童由于肠道功能发育还不成熟，在拉肚子时也较易发生肠道痉挛，因为儿童的肠道对环境变化更敏感，比如饮食稍有不注意引发拉肚子，就可能很快出现肠道痉挛性腹痛，需要特别关注其腹部保暖等情况来缓解不适。
