腹泻的原因包括感染性因素和非感染性因素。感染性因素有病毒感染（轮状病毒、诺如病毒）、细菌感染（大肠杆菌、沙门菌）、寄生虫感染（蓝氏贾第鞭毛虫）；非感染性因素有饮食因素（食物过敏、饮食不当）、药物副作用（某些抗生素、泻药）、其他因素（腹部着凉、肠道功能紊乱、内分泌及代谢障碍疾病）。
一、感染性因素
（一）病毒感染
1.轮状病毒：是婴幼儿腹泻的常见病原体，多见于6-24月龄婴幼儿，可通过粪-口途径传播。感染后主要引起小肠绒毛上皮细胞损伤，影响肠道的吸收功能，导致腹泻，多为水样便或蛋花汤样便，常伴有发热、呕吐等症状，全球每年约有1.11亿-1.4亿例轮状病毒腹泻病例，其中约270万-403万例住院，且在寒冷季节高发。
2.诺如病毒：全年均可发生感染，多见于成人和学龄儿童，通过污染的食物、水传播。感染后主要表现为急性胃肠炎，症状包括腹泻、恶心、呕吐、腹痛等，腹泻多为稀水便或水样便，病程一般较短，但易在学校、托幼机构等集体场所暴发流行，据统计，诺如病毒每年在全球引起约6.85亿例胃肠炎病例。
（二）细菌感染
1.大肠杆菌：常见的有产毒性大肠杆菌、侵袭性大肠杆菌等。产毒性大肠杆菌可产生肠毒素，引起分泌性腹泻，多发生在婴幼儿和旅游者中，腹泻为水样便，量较多；侵袭性大肠杆菌可侵入肠道黏膜，引起炎症反应，出现黏液脓血便，伴有腹痛、发热等症状，在卫生条件较差的地区较为常见。
2.沙门菌：通过食用被污染的肉类、蛋类等食物传播，可引起急性肠炎，患者出现腹泻、腹痛、发热等症状，腹泻次数不等，可为稀便或黏液脓血便，沙门菌感染在全球范围内均有发生，是引起食源性疾病的重要病原菌之一。
（三）寄生虫感染
1.蓝氏贾第鞭毛虫：主要通过污染的水传播，人体感染后可引起腹泻，多为间歇性腹泻，大便呈糊状或稀水样，有恶臭味，部分患者可伴有腹痛、腹胀、恶心、呕吐等症状，在卫生设施不完善的地区感染率较高。
二、非感染性因素
（一）饮食因素
1.食物过敏：如对牛奶、海鲜等食物过敏的人群，进食相关食物后可引起肠道过敏反应，出现腹泻、腹痛，还可能伴有皮疹、瘙痒等其他过敏症状，婴幼儿对牛奶蛋白过敏较为常见，据统计，婴幼儿牛奶蛋白过敏的发生率约为2%-7%。
2.饮食不当：短期内进食过多油腻、刺激性食物或进食不规律，可导致胃肠消化功能紊乱，引起腹泻、腹痛。例如，大量食用辛辣食物后，可刺激肠道黏膜，导致肠道蠕动加快，出现腹痛、腹泻症状。
（二）药物副作用
1.某些抗生素：长期或不规范使用抗生素可引起肠道菌群失调，导致腹泻、腹痛。例如，广谱抗生素的使用可破坏肠道正常菌群的平衡，使耐药菌过度繁殖，引起伪膜性肠炎等，出现腹泻、腹痛、发热等症状，使用抗生素后发生肠道菌群失调的概率因药物种类和个体差异而异，一般在5%-30%左右。
2.泻药：长期滥用泻药可导致肠道对泻药产生依赖，肠道自主蠕动功能减弱，突然停药或改变泻药使用方式时可出现腹泻、腹痛等症状。
（三）其他因素
1.腹部着凉：腹部受到寒冷刺激后，可引起肠道痉挛，导致腹痛、腹泻，尤其在儿童中较为常见，儿童的腹部脂肪较薄，体温调节能力相对较弱，更容易因腹部着凉出现上述症状。
2.肠道功能紊乱：如肠易激综合征，多见于中青年人群，与精神因素、胃肠动力异常、肠道菌群失调等多种因素有关，患者主要表现为腹痛、腹泻或便秘，症状可反复发作，精神紧张、焦虑等情绪因素可诱发或加重症状。
3.内分泌及代谢障碍疾病：如甲状腺功能亢进症，由于甲状腺激素分泌过多，可加速胃肠蠕动，导致腹泻、腹痛，同时还可伴有多汗、心慌、消瘦等症状；肾上腺皮质功能减退症等疾病也可能影响胃肠功能，引起腹泻、腹痛等表现。
