急性胃肠炎需与其他消化系统疾病鉴别，包括消化性溃疡、胆囊炎、阑尾炎，具体分析如下：
1.消化性溃疡
消化性溃疡患者多有慢性、周期性、节律性上腹痛的特点，胃溃疡疼痛多在餐后半小时至1小时出现，至下次进餐前缓解；十二指肠溃疡疼痛多在空腹时发作，进食后缓解。而急性胃肠炎起病急，主要表现为恶心、呕吐、腹痛、腹泻，疼痛部位不固定，多为阵发性绞痛。通过胃镜检查可明确消化性溃疡的诊断，而急性胃肠炎胃镜下多无明显溃疡病灶。年龄方面，老年人消化性溃疡症状可能不典型，而儿童急性胃肠炎更为常见。有长期服用非甾体抗炎药等病史的人群更易患消化性溃疡。
2.胆囊炎
胆囊炎患者主要表现为右上腹疼痛，可向右肩部或背部放射，疼痛较为剧烈，呈持续性钝痛或阵发性绞痛，常伴有发热、黄疸等症状。急性胃肠炎的腹痛部位多在脐周或全腹，且一般无黄疸表现。腹部超声检查可发现胆囊炎患者胆囊壁增厚、毛糙，胆囊增大等表现，有助于鉴别。生活方式上，长期高脂饮食的人群易患胆囊炎。
3.阑尾炎
阑尾炎典型症状为转移性右下腹痛，即开始时疼痛多在上腹部或脐周，数小时后转移并固定于右下腹。急性胃肠炎腹痛部位不固定且无转移性特点。血常规检查可见阑尾炎患者白细胞及中性粒细胞升高更为明显。儿童患阑尾炎时病情发展较快，穿孔率较高，需格外注意。有肠道寄生虫病史等可能增加阑尾炎的发病风险。
