子宫囊肿分为生理性和病理性。生理性包括卵泡囊肿（与月经周期卵泡发育、排卵异常有关，育龄期女性易出现）和黄体囊肿（与黄体期激素变化等有关，育龄女性易发生，绝经后无）；病理性包括子宫内膜异位囊肿（因子宫内膜异位种植卵巢出血形成，育龄女性常见，有家族史等风险高）、炎性囊肿（盆腔炎症累及附件致渗出物积聚，有宫腔操作等高危因素女性风险高）、上皮性囊肿（宫颈纳氏囊肿与宫颈炎症等有关，育龄有性生活史女性易患；卵巢上皮性囊肿与年龄、局部微环境等有关，绝经后女性易出现，既往卵巢炎症病史等增加风险）
一、生理性子宫囊肿的形成
（一）卵泡囊肿
1.形成机制：正常情况下，卵巢内的卵泡会随着月经周期发生发育、成熟及排卵等过程。当卵泡生长到一定大小后，本应排卵，如果卵泡没有破裂排出卵子，卵泡液积聚在卵泡内，就会形成卵泡囊肿。这与女性正常的月经周期生理变化相关，一般在月经周期的特定阶段都有可能出现，多数可自行消退，对身体影响相对较小，常见于育龄期女性，与正常的内分泌调节及卵泡发育过程中的偶然异常有关。
2.年龄因素影响：育龄期女性由于内分泌相对活跃，卵泡发育相关的激素波动相对明显，相比儿童期或绝经后女性，更易出现卵泡囊肿这种生理性情况，但这也属于正常生理过程中的波动范畴。
（二）黄体囊肿
1.形成机制：排卵后，卵泡壁会塌陷形成黄体。如果黄体持续存在并且不断增大，黄体腔内有大量的积液积聚，就会形成黄体囊肿。它的形成与黄体期的激素变化以及黄体自身的代谢等有关，一般在月经周期的黄体期出现，多数也可在下次月经后自行消失。育龄期女性在黄体期都有发生黄体囊肿的可能性，这是基于正常的排卵后黄体形成及可能出现的异常潴留情况。
2.年龄与性别因素：主要发生在育龄女性，因为只有在有排卵的育龄阶段才会有黄体形成的过程，绝经后女性由于卵巢功能衰退，不再有排卵及黄体形成，所以一般不会出现黄体囊肿。
二、病理性子宫囊肿的形成
（一）子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）
1.形成机制：子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位时称为子宫内膜异位症，当异位的子宫内膜种植在卵巢上，随着月经周期发生出血，血液积聚在卵巢内形成囊肿，由于陈旧性血液呈褐色，似巧克力样，所以称为巧克力囊肿。其发生与子宫内膜的异位种植有关，可能与经血逆流、遗传因素、免疫因素等相关。有子宫内膜异位症家族史的女性发病风险相对较高，这种情况在育龄女性中较为常见，尤其是有过剖宫产、宫腔操作等可能导致子宫内膜异位种植机会增加的女性。
2.年龄与生活方式因素：多见于育龄女性，长期的月经不调、经期剧烈运动等可能增加经血逆流的风险，从而促进巧克力囊肿的形成。另外，遗传因素方面，如果家族中有直系亲属患有子宫内膜异位症，个体发病概率会升高。
（二）炎性囊肿
1.形成机制：盆腔炎症累及子宫附件时，炎症刺激导致输卵管或卵巢周围组织粘连，炎性渗出物积聚形成囊肿，称为炎性囊肿。常见的病原体感染如沙眼衣原体、淋病奈瑟菌等感染盆腔，引发炎症反应。女性如果有不洁性生活史、多次宫腔操作史等，容易导致盆腔感染，进而引发炎性囊肿。各年龄段女性都可能发生，但有相关高危因素接触史的女性风险更高，比如有过多次人工流产史的女性，宫腔操作后细菌容易上行感染引发盆腔炎症。
2.病史因素：有宫腔操作病史（如人工流产、刮宫等）、不洁性生活史的女性，既往盆腔炎症病史未彻底治愈等情况，都可能成为炎性囊肿形成的病史诱因，增加患病风险。
（三）上皮性囊肿
1.形成机制：子宫颈或卵巢表面的上皮细胞异常增生、分泌等导致囊肿形成。例如宫颈纳氏囊肿，是由于宫颈腺管口被阻塞，腺体分泌物引流受阻、潴留形成囊肿。其具体机制可能与宫颈局部的炎症、损伤等有关，长期的宫颈慢性炎症刺激可导致腺管口狭窄，引发纳氏囊肿。而卵巢的上皮性囊肿可能与卵巢上皮细胞的异常增殖分化等相关，但具体确切机制尚在研究中，不过局部的炎症、内分泌紊乱等可能是诱发因素。各年龄段女性均可发生宫颈纳氏囊肿，而卵巢上皮性囊肿在育龄及绝经后女性都有出现可能，与卵巢局部的微环境变化等有关。
2.年龄与病史因素：宫颈纳氏囊肿多见于有性生活史的女性，尤其是育龄女性，长期的宫颈炎症刺激是常见诱因；卵巢上皮性囊肿的发生与年龄相关，绝经后女性由于卵巢功能变化，上皮细胞相关的调节机制改变，可能更易出现上皮性囊肿，同时既往有卵巢相关炎症病史等也可能增加发病风险。
