脑干出血通常难以完全恢复，多数会遗留不同程度的神经功能障碍，具体与出血情况相关。
脑干是人体生命中枢，负责呼吸、心跳等基本功能，该区域神经密集且结构复杂，即使少量出血也可能损伤关键神经核团。若出血量大（超过5毫升），会迅速压迫脑干组织，导致昏迷、呼吸循环衰竭，甚至危及生命，幸存者往往伴随严重后遗症。少量出血（3毫升以内）且位于非关键区域时，症状可能较轻，恢复相对较好，但仍可能遗留头晕、肢体无力等问题。
治疗及时性和后续康复对恢复至关重要。发病后6小时内进行脱水降颅压、稳定生命体征等治疗，可减少脑干损伤。病情稳定后尽早开展康复训练，能促进神经功能代偿，但神经细胞不可再生，受损功能难以完全逆转。年轻患者、无基础疾病者恢复潜力相对较大，而高龄、合并糖尿病等基础病者恢复较慢。监测血压、控制出血诱因，可降低再出血风险，改善长期预后。
