脸上长黑痣与遗传因素、紫外线照射、胚胎发育时期异常、激素变化相关，遗传使个体易感性增加，紫外线刺激黑色素细胞产黑色素，胚胎发育中黑色素细胞异常聚集，激素变化影响黑色素细胞功能分布致其合成增加形成黑痣。
遗传因素：部分黑痣的形成与遗传有关。如果家族中有黑痣相关的遗传倾向，那么个体发生黑痣的概率可能会相对较高。研究表明，某些特定的基因变异可能会增加黑痣产生的易感性，这种遗传因素在一些家族性黑痣聚集的情况中较为明显，从基因层面影响黑色素细胞的分布、增殖等过程，从而导致脸上出现黑痣。
紫外线照射：长期暴露在紫外线下是脸上长黑痣的重要诱因之一。紫外线会刺激皮肤中的黑色素细胞产生更多的黑色素。当皮肤受到紫外线的反复照射时，黑色素细胞会被激活，大量合成黑色素，进而形成黑痣。例如，长期从事户外工作且没有做好防晒措施的人群，脸上出现黑痣的几率往往比室内工作者更高。因为紫外线中的紫外线B（UVB）和紫外线A（UVA）会损伤皮肤细胞的DNA，促使黑色素细胞异常分泌黑色素，逐渐聚集形成黑痣。
胚胎发育时期的异常：在胚胎发育过程中，如果黑色素细胞在迁徙过程中出现异常聚集，也会导致脸上长黑痣。胚胎发育阶段是各种组织和细胞分化形成的关键时期，黑色素细胞原本应该有序地分布在皮肤中，如果这个过程出现紊乱，部分黑色素细胞就会在某个部位聚集停留，最终形成黑痣。这种情况是胚胎发育过程中的偶然异常导致，一般在出生时或出生后不久就能发现相关黑痣。
激素变化：体内激素水平的变化也可能影响黑痣的形成。例如青春期、孕期等特殊时期，体内激素水平波动较大。在青春期，身体的内分泌系统发生改变，雌激素、雄激素等激素水平的变化可能会刺激黑色素细胞活跃，导致黑痣出现或原有黑痣发生变化。孕期女性体内激素水平大幅改变，也可能促使脸上黑痣增多或颜色加深，这是因为激素变化会影响黑色素细胞的功能和分布，使得黑色素合成增加，进而形成黑痣。
