支原体感染后因病原体可黏附上皮细胞且代谢产物持续刺激、不易被迅速完全清除致病程可迁延至半年左右，儿童尤其是婴幼儿因免疫系统不完善、成人有基础病等个体差异恢复进程受影响，且支原体肺炎可引发肺不张、闭塞性细支气管炎等并发症，恢复后还可能出现气道重塑等后续改变致恢复周期延长。
一、支原体病原体特性导致病程迁延
支原体感染后，其繁殖过程及引发的免疫反应具有特殊性。支原体可黏附于呼吸道上皮细胞，其代谢产物会持续刺激机体，且支原体不易被迅速完全清除，机体免疫系统需较长时间来逐步调控清除过程，此过程可能持续数月，从而使得病程延长至半年左右。
二、个体差异影响恢复进程
1.年龄因素：儿童尤其是婴幼儿，免疫系统发育尚不完善，对支原体感染的应对能力相对较弱，清除病原体及修复受损呼吸道黏膜等组织的速度较慢，故恢复时间可能更长，部分儿童支原体肺炎恢复至半年左右较为常见；而成人免疫系统相对成熟，但若存在基础疾病等情况，也可能因自身修复能力及对感染的反应程度不同而延长病程。
2.基础健康状况：本身患有慢性呼吸道疾病（如哮喘、慢性阻塞性肺疾病等）或免疫功能低下者（如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂者），在感染支原体肺炎后，机体修复能力及对感染的应对能力受限，病原体清除及肺部损伤修复过程受阻，进而导致恢复时间延长至半年。
三、并发症及后续修复问题
1.并发症影响：支原体肺炎可能引发多种并发症，如肺不张、闭塞性细支气管炎等。肺不张会影响肺部通气换气功能，需要较长时间来恢复肺组织的正常形态和功能；闭塞性细支气管炎会导致气道狭窄，进一步影响呼吸，使得患者恢复周期延长。
2.气道重塑等后续改变：部分支原体肺炎患者在感染恢复后可能出现气道重塑，即气道结构发生改变，如气道平滑肌增生、气道壁增厚等，这会导致气道高反应性，使得患者在感染恢复后仍可能存在咳嗽等症状，且恢复正常气道功能需要较长时间，可能持续数月甚至半年。
