慢性胃炎需与其他相似疾病进行鉴别，如消化性溃疡，功能性消化不良，胆囊炎、胆石症。
1.消化性溃疡
消化性溃疡患者的疼痛具有节律性和周期性。胃溃疡疼痛多在餐后半小时至1小时出现，至下次进餐前缓解；十二指肠溃疡疼痛常为空腹痛，即餐后3-4小时出现，进食后缓解，还可出现夜间痛。而慢性胃炎的疼痛一般无明显节律性。胃镜检查是鉴别两者的关键，消化性溃疡在胃镜下可见圆形或椭圆形的溃疡病灶，边界清晰，底部平整，周围黏膜可有充血、水肿；慢性胃炎则主要表现为胃黏膜的充血、水肿、糜烂等改变。
2.功能性消化不良
功能性消化不良患者也有上腹部饱胀、疼痛、早饱、嗳气等症状，但通过胃镜、B超等检查无明显器质性病变。而慢性胃炎有胃黏膜的炎症改变。功能性消化不良的症状多与精神因素、饮食等有关，心理因素对症状的影响较为明显；慢性胃炎的症状主要与胃黏膜的炎症状态相关。
3.胆囊炎、胆石症
胆囊炎、胆石症患者常有右上腹疼痛，可向右肩部或背部放射，部分患者可伴有发热、黄疸等症状。疼痛多在进食油腻食物后诱发或加重。腹部B超检查可发现胆囊增大、胆囊壁增厚、胆囊内有结石等表现。而慢性胃炎的疼痛部位多在上腹部正中或偏左，与进食油腻食物关系不密切，腹部B超检查一般无胆囊的异常改变。
